Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Chaf1aQ9QWF0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Chaf1aQ9QWF0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chaf1aQ9QWF0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chaf1aQ9QWF0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chaf1aQ9QWF0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chaf1aQ9QWF0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chaf1aQ9QWF0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chaf1aQ9QWF0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chaf1aQ9QWF0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chaf1aQ9QWF0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chaf1aQ9QWF0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chaf1aQ9QWF0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chaf1aQ9QWF0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chaf1aQ9QWF0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chaf1aQ9QWF0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chaf1aQ9QWF0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chaf1aQ9QWF0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chaf1aQ9QWF0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chaf1aQ9QWF0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chaf1aQ9QWF0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chaf1aQ9QWF0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chaf1aQ9QWF0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chaf1aQ9QWF0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chaf1aQ9QWF0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chaf1aQ9QWF0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chaf1aQ9QWF0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chaf1aQ9QWF0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chaf1aQ9QWF0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chaf1aQ9QWF0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chaf1aQ9QWF0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Chaf1aQ9QWF0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chaf1aQ9QWF0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chaf1aQ9QWF0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Chaf1aQ9QWF0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chaf1aQ9QWF0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chaf1aQ9QWF0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chaf1aQ9QWF0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chaf1aQ9QWF0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chaf1aQ9QWF0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chaf1aQ9QWF0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chaf1aQ9QWF0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Chaf1aQ9QWF0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chaf1aQ9QWF0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Chaf1aQ9QWF0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chaf1aQ9QWF0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chaf1aQ9QWF0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chaf1aQ9QWF0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Chaf1aQ9QWF0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chaf1aQ9QWF0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chaf1aQ9QWF0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chaf1aQ9QWF0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chaf1aQ9QWF0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chaf1aQ9QWF0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chaf1aQ9QWF0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chaf1aQ9QWF0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chaf1aQ9QWF0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chaf1aQ9QWF0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chaf1aQ9QWF0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chaf1aQ9QWF0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chaf1aQ9QWF0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chaf1aQ9QWF0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chaf1aQ9QWF0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chaf1aQ9QWF0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chaf1aQ9QWF0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chaf1aQ9QWF0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chaf1aQ9QWF0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chaf1aQ9QWF0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chaf1aQ9QWF0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chaf1aQ9QWF0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chaf1aQ9QWF0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chaf1aQ9QWF0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chaf1aQ9QWF0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chaf1aQ9QWF0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chaf1aQ9QWF0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chaf1aQ9QWF0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chaf1aQ9QWF0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chaf1aQ9QWF0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chaf1aQ9QWF0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chaf1aQ9QWF0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chaf1aQ9QWF0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chaf1aQ9QWF0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chaf1aQ9QWF0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chaf1aQ9QWF0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chaf1aQ9QWF0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chaf1aQ9QWF0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chaf1aQ9QWF0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chaf1aQ9QWF0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chaf1aQ9QWF0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chaf1aQ9QWF0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chaf1aQ9QWF0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chaf1aQ9QWF0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chaf1aQ9QWF0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chaf1aQ9QWF0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chaf1aQ9QWF0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chaf1aQ9QWF0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chaf1aQ9QWF0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chaf1aQ9QWF0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chaf1aQ9QWF0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms