Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMA7

Cyp3a41a, Cytochrome P450 3A41, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a41aQ9JMA7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp3a41aQ9JMA7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp3a41aQ9JMA7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp3a41aQ9JMA7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp3a41aQ9JMA7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp3a41aQ9JMA7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp3a41aQ9JMA7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp3a41aQ9JMA7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp3a41aQ9JMA7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp3a41aQ9JMA7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp3a41aQ9JMA7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp3a41aQ9JMA7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp3a41aQ9JMA7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp3a41aQ9JMA7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp3a41aQ9JMA7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp3a41aQ9JMA7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp3a41aQ9JMA7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cyp3a41aQ9JMA7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp3a41aQ9JMA7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp3a41aQ9JMA7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp3a41aQ9JMA7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp3a41aQ9JMA7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp3a41aQ9JMA7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp3a41aQ9JMA7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp3a41aQ9JMA7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp3a41aQ9JMA7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp3a41aQ9JMA7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp3a41aQ9JMA7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp3a41aQ9JMA7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp3a41aQ9JMA7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cyp3a41aQ9JMA7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp3a41aQ9JMA7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp3a41aQ9JMA7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp3a41aQ9JMA7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp3a41aQ9JMA7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp3a41aQ9JMA7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp3a41aQ9JMA7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp3a41aQ9JMA7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp3a41aQ9JMA7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp3a41aQ9JMA7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp3a41aQ9JMA7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp3a41aQ9JMA7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp3a41aQ9JMA7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp3a41aQ9JMA7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp3a41aQ9JMA7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp3a41aQ9JMA7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp3a41aQ9JMA7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp3a41aQ9JMA7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp3a41aQ9JMA7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp3a41aQ9JMA7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp3a41aQ9JMA7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp3a41aQ9JMA7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp3a41aQ9JMA7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp3a41aQ9JMA7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp3a41aQ9JMA7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cyp3a41aQ9JMA7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cyp3a41aQ9JMA7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp3a41aQ9JMA7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp3a41aQ9JMA7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp3a41aQ9JMA7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp3a41aQ9JMA7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp3a41aQ9JMA7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp3a41aQ9JMA7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp3a41aQ9JMA7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp3a41aQ9JMA7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp3a41aQ9JMA7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp3a41aQ9JMA7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp3a41aQ9JMA7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp3a41aQ9JMA7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp3a41aQ9JMA7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp3a41aQ9JMA7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp3a41aQ9JMA7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp3a41aQ9JMA7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp3a41aQ9JMA7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp3a41aQ9JMA7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp3a41aQ9JMA7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp3a41aQ9JMA7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp3a41aQ9JMA7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp3a41aQ9JMA7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp3a41aQ9JMA7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp3a41aQ9JMA7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp3a41aQ9JMA7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms