Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PnkpQ9JLV6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PnkpQ9JLV6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PnkpQ9JLV6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PnkpQ9JLV6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PnkpQ9JLV6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PnkpQ9JLV6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PnkpQ9JLV6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PnkpQ9JLV6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PnkpQ9JLV6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PnkpQ9JLV6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PnkpQ9JLV6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PnkpQ9JLV6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PnkpQ9JLV6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PnkpQ9JLV6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PnkpQ9JLV6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PnkpQ9JLV6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PnkpQ9JLV6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PnkpQ9JLV6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PnkpQ9JLV6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PnkpQ9JLV6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PnkpQ9JLV6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PnkpQ9JLV6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PnkpQ9JLV6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PnkpQ9JLV6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PnkpQ9JLV6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PnkpQ9JLV6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PnkpQ9JLV6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PnkpQ9JLV6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PnkpQ9JLV6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PnkpQ9JLV6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PnkpQ9JLV6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PnkpQ9JLV6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PnkpQ9JLV6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PnkpQ9JLV6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PnkpQ9JLV6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PnkpQ9JLV6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PnkpQ9JLV6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PnkpQ9JLV6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PnkpQ9JLV6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PnkpQ9JLV6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PnkpQ9JLV6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PnkpQ9JLV6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PnkpQ9JLV6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PnkpQ9JLV6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PnkpQ9JLV6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PnkpQ9JLV6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PnkpQ9JLV6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PnkpQ9JLV6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PnkpQ9JLV6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PnkpQ9JLV6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PnkpQ9JLV6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PnkpQ9JLV6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PnkpQ9JLV6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PnkpQ9JLV6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PnkpQ9JLV6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PnkpQ9JLV6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PnkpQ9JLV6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PnkpQ9JLV6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PnkpQ9JLV6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PnkpQ9JLV6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PnkpQ9JLV6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PnkpQ9JLV6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PnkpQ9JLV6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PnkpQ9JLV6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PnkpQ9JLV6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PnkpQ9JLV6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PnkpQ9JLV6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PnkpQ9JLV6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PnkpQ9JLV6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PnkpQ9JLV6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PnkpQ9JLV6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PnkpQ9JLV6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PnkpQ9JLV6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PnkpQ9JLV6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PnkpQ9JLV6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PnkpQ9JLV6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PnkpQ9JLV6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PnkpQ9JLV6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PnkpQ9JLV6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PnkpQ9JLV6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PnkpQ9JLV6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PnkpQ9JLV6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PnkpQ9JLV6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PnkpQ9JLV6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PnkpQ9JLV6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PnkpQ9JLV6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PnkpQ9JLV6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PnkpQ9JLV6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PnkpQ9JLV6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PnkpQ9JLV6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PnkpQ9JLV6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PnkpQ9JLV6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PnkpQ9JLV6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PnkpQ9JLV6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PnkpQ9JLV6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PnkpQ9JLV6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PnkpQ9JLV6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PnkpQ9JLV6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PnkpQ9JLV6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms