Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul3Q9JLV5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul3Q9JLV5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul3Q9JLV5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul3Q9JLV5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul3Q9JLV5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul3Q9JLV5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul3Q9JLV5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul3Q9JLV5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul3Q9JLV5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul3Q9JLV5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul3Q9JLV5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul3Q9JLV5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul3Q9JLV5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul3Q9JLV5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul3Q9JLV5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul3Q9JLV5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul3Q9JLV5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul3Q9JLV5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul3Q9JLV5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul3Q9JLV5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul3Q9JLV5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul3Q9JLV5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul3Q9JLV5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul3Q9JLV5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul3Q9JLV5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul3Q9JLV5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul3Q9JLV5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul3Q9JLV5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul3Q9JLV5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul3Q9JLV5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul3Q9JLV5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul3Q9JLV5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul3Q9JLV5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul3Q9JLV5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul3Q9JLV5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul3Q9JLV5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul3Q9JLV5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul3Q9JLV5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul3Q9JLV5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul3Q9JLV5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul3Q9JLV5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul3Q9JLV5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul3Q9JLV5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul3Q9JLV5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cul3Q9JLV5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cul3Q9JLV5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul3Q9JLV5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul3Q9JLV5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul3Q9JLV5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul3Q9JLV5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul3Q9JLV5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul3Q9JLV5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul3Q9JLV5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul3Q9JLV5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul3Q9JLV5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul3Q9JLV5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul3Q9JLV5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul3Q9JLV5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul3Q9JLV5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul3Q9JLV5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul3Q9JLV5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul3Q9JLV5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul3Q9JLV5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul3Q9JLV5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul3Q9JLV5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul3Q9JLV5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul3Q9JLV5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul3Q9JLV5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul3Q9JLV5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul3Q9JLV5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul3Q9JLV5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul3Q9JLV5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul3Q9JLV5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul3Q9JLV5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul3Q9JLV5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul3Q9JLV5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul3Q9JLV5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul3Q9JLV5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul3Q9JLV5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul3Q9JLV5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul3Q9JLV5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul3Q9JLV5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul3Q9JLV5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul3Q9JLV5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul3Q9JLV5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul3Q9JLV5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul3Q9JLV5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cul3Q9JLV5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cul3Q9JLV5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cul3Q9JLV5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cul3Q9JLV5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cul3Q9JLV5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cul3Q9JLV5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cul3Q9JLV5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cul3Q9JLV5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cul3Q9JLV5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cul3Q9JLV5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cul3Q9JLV5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cul3Q9JLV5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms