Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pkd2l2Q9JLG4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pkd2l2Q9JLG4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pkd2l2Q9JLG4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pkd2l2Q9JLG4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pkd2l2Q9JLG4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Pkd2l2Q9JLG4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pkd2l2Q9JLG4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pkd2l2Q9JLG4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkd2l2Q9JLG4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkd2l2Q9JLG4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkd2l2Q9JLG4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkd2l2Q9JLG4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pkd2l2Q9JLG4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkd2l2Q9JLG4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkd2l2Q9JLG4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pkd2l2Q9JLG4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pkd2l2Q9JLG4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pkd2l2Q9JLG4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pkd2l2Q9JLG4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pkd2l2Q9JLG4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pkd2l2Q9JLG4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pkd2l2Q9JLG4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Pkd2l2Q9JLG4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pkd2l2Q9JLG4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkd2l2Q9JLG4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkd2l2Q9JLG4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkd2l2Q9JLG4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pkd2l2Q9JLG4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkd2l2Q9JLG4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pkd2l2Q9JLG4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pkd2l2Q9JLG4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pkd2l2Q9JLG4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkd2l2Q9JLG4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkd2l2Q9JLG4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkd2l2Q9JLG4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkd2l2Q9JLG4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pkd2l2Q9JLG4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Pkd2l2Q9JLG4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pkd2l2Q9JLG4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pkd2l2Q9JLG4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pkd2l2Q9JLG4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Pkd2l2Q9JLG4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pkd2l2Q9JLG4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pkd2l2Q9JLG4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Pkd2l2Q9JLG4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pkd2l2Q9JLG4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pkd2l2Q9JLG4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pkd2l2Q9JLG4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pkd2l2Q9JLG4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pkd2l2Q9JLG4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Pkd2l2Q9JLG4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pkd2l2Q9JLG4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pkd2l2Q9JLG4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pkd2l2Q9JLG4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pkd2l2Q9JLG4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pkd2l2Q9JLG4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pkd2l2Q9JLG4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Pkd2l2Q9JLG4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pkd2l2Q9JLG4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkd2l2Q9JLG4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkd2l2Q9JLG4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkd2l2Q9JLG4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkd2l2Q9JLG4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkd2l2Q9JLG4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkd2l2Q9JLG4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pkd2l2Q9JLG4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Pkd2l2Q9JLG4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pkd2l2Q9JLG4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pkd2l2Q9JLG4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pkd2l2Q9JLG4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pkd2l2Q9JLG4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pkd2l2Q9JLG4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pkd2l2Q9JLG4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pkd2l2Q9JLG4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pkd2l2Q9JLG4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pkd2l2Q9JLG4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pkd2l2Q9JLG4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms