Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc5a3Q9JKZ2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc5a3Q9JKZ2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc5a3Q9JKZ2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc5a3Q9JKZ2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc5a3Q9JKZ2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc5a3Q9JKZ2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc5a3Q9JKZ2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc5a3Q9JKZ2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc5a3Q9JKZ2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc5a3Q9JKZ2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc5a3Q9JKZ2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc5a3Q9JKZ2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc5a3Q9JKZ2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc5a3Q9JKZ2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc5a3Q9JKZ2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc5a3Q9JKZ2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc5a3Q9JKZ2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc5a3Q9JKZ2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc5a3Q9JKZ2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc5a3Q9JKZ2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc5a3Q9JKZ2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a3Q9JKZ2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a3Q9JKZ2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc5a3Q9JKZ2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc5a3Q9JKZ2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc5a3Q9JKZ2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc5a3Q9JKZ2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc5a3Q9JKZ2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc5a3Q9JKZ2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc5a3Q9JKZ2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc5a3Q9JKZ2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc5a3Q9JKZ2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc5a3Q9JKZ2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc5a3Q9JKZ2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc5a3Q9JKZ2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc5a3Q9JKZ2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc5a3Q9JKZ2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc5a3Q9JKZ2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc5a3Q9JKZ2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc5a3Q9JKZ2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc5a3Q9JKZ2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc5a3Q9JKZ2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc5a3Q9JKZ2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc5a3Q9JKZ2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc5a3Q9JKZ2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc5a3Q9JKZ2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc5a3Q9JKZ2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc5a3Q9JKZ2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc5a3Q9JKZ2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc5a3Q9JKZ2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Slc5a3Q9JKZ2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc5a3Q9JKZ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc5a3Q9JKZ2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc5a3Q9JKZ2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc5a3Q9JKZ2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc5a3Q9JKZ2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc5a3Q9JKZ2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc5a3Q9JKZ2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc5a3Q9JKZ2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc5a3Q9JKZ2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc5a3Q9JKZ2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc5a3Q9JKZ2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc5a3Q9JKZ2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc5a3Q9JKZ2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc5a3Q9JKZ2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc5a3Q9JKZ2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc5a3Q9JKZ2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc5a3Q9JKZ2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc5a3Q9JKZ2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc5a3Q9JKZ2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc5a3Q9JKZ2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc5a3Q9JKZ2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc5a3Q9JKZ2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc5a3Q9JKZ2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc5a3Q9JKZ2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc5a3Q9JKZ2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc5a3Q9JKZ2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc5a3Q9JKZ2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc5a3Q9JKZ2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc5a3Q9JKZ2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc5a3Q9JKZ2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc5a3Q9JKZ2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc5a3Q9JKZ2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc5a3Q9JKZ2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc5a3Q9JKZ2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc5a3Q9JKZ2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc5a3Q9JKZ2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc5a3Q9JKZ2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc5a3Q9JKZ2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc5a3Q9JKZ2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc5a3Q9JKZ2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc5a3Q9JKZ2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc5a3Q9JKZ2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc5a3Q9JKZ2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc5a3Q9JKZ2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc5a3Q9JKZ2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc5a3Q9JKZ2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc5a3Q9JKZ2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms