Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Arl6ip1Q9JKW0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arl6ip1Q9JKW0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arl6ip1Q9JKW0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arl6ip1Q9JKW0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arl6ip1Q9JKW0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arl6ip1Q9JKW0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arl6ip1Q9JKW0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arl6ip1Q9JKW0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arl6ip1Q9JKW0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arl6ip1Q9JKW0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Arl6ip1Q9JKW0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arl6ip1Q9JKW0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arl6ip1Q9JKW0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arl6ip1Q9JKW0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arl6ip1Q9JKW0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arl6ip1Q9JKW0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arl6ip1Q9JKW0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arl6ip1Q9JKW0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arl6ip1Q9JKW0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arl6ip1Q9JKW0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arl6ip1Q9JKW0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arl6ip1Q9JKW0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arl6ip1Q9JKW0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arl6ip1Q9JKW0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Arl6ip1Q9JKW0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arl6ip1Q9JKW0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arl6ip1Q9JKW0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Arl6ip1Q9JKW0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arl6ip1Q9JKW0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arl6ip1Q9JKW0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arl6ip1Q9JKW0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Arl6ip1Q9JKW0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arl6ip1Q9JKW0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arl6ip1Q9JKW0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arl6ip1Q9JKW0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arl6ip1Q9JKW0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arl6ip1Q9JKW0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arl6ip1Q9JKW0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arl6ip1Q9JKW0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arl6ip1Q9JKW0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arl6ip1Q9JKW0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arl6ip1Q9JKW0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arl6ip1Q9JKW0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arl6ip1Q9JKW0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arl6ip1Q9JKW0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arl6ip1Q9JKW0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Arl6ip1Q9JKW0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Arl6ip1Q9JKW0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Arl6ip1Q9JKW0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Arl6ip1Q9JKW0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Arl6ip1Q9JKW0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Arl6ip1Q9JKW0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Arl6ip1Q9JKW0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Arl6ip1Q9JKW0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Arl6ip1Q9JKW0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Arl6ip1Q9JKW0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Arl6ip1Q9JKW0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Arl6ip1Q9JKW0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arl6ip1Q9JKW0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Arl6ip1Q9JKW0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arl6ip1Q9JKW0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arl6ip1Q9JKW0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arl6ip1Q9JKW0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arl6ip1Q9JKW0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms