Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Stx6Q9JKK1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Stx6Q9JKK1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Stx6Q9JKK1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Stx6Q9JKK1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Stx6Q9JKK1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Stx6Q9JKK1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Stx6Q9JKK1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Stx6Q9JKK1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Stx6Q9JKK1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Stx6Q9JKK1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Stx6Q9JKK1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Stx6Q9JKK1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Stx6Q9JKK1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stx6Q9JKK1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stx6Q9JKK1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stx6Q9JKK1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Stx6Q9JKK1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Stx6Q9JKK1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Stx6Q9JKK1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Stx6Q9JKK1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Stx6Q9JKK1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Stx6Q9JKK1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Stx6Q9JKK1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Stx6Q9JKK1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Stx6Q9JKK1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Stx6Q9JKK1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Stx6Q9JKK1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Stx6Q9JKK1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Stx6Q9JKK1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Stx6Q9JKK1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Stx6Q9JKK1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Stx6Q9JKK1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Stx6Q9JKK1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Stx6Q9JKK1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Stx6Q9JKK1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Stx6Q9JKK1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Stx6Q9JKK1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Stx6Q9JKK1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Stx6Q9JKK1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Stx6Q9JKK1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Stx6Q9JKK1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Stx6Q9JKK1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Stx6Q9JKK1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Stx6Q9JKK1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Stx6Q9JKK1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Stx6Q9JKK1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Stx6Q9JKK1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Stx6Q9JKK1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Stx6Q9JKK1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Stx6Q9JKK1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Stx6Q9JKK1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Stx6Q9JKK1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Stx6Q9JKK1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Stx6Q9JKK1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Stx6Q9JKK1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Stx6Q9JKK1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stx6Q9JKK1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Stx6Q9JKK1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stx6Q9JKK1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stx6Q9JKK1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stx6Q9JKK1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stx6Q9JKK1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Stx6Q9JKK1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Stx6Q9JKK1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Stx6Q9JKK1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Stx6Q9JKK1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Stx6Q9JKK1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Stx6Q9JKK1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Stx6Q9JKK1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Stx6Q9JKK1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Stx6Q9JKK1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Stx6Q9JKK1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stx6Q9JKK1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stx6Q9JKK1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Stx6Q9JKK1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Stx6Q9JKK1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Stx6Q9JKK1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Stx6Q9JKK1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Stx6Q9JKK1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Stx6Q9JKK1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Stx6Q9JKK1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Stx6Q9JKK1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Stx6Q9JKK1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Stx6Q9JKK1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Stx6Q9JKK1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Stx6Q9JKK1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Stx6Q9JKK1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Stx6Q9JKK1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Stx6Q9JKK1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Stx6Q9JKK1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Stx6Q9JKK1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Stx6Q9JKK1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Stx6Q9JKK1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Stx6Q9JKK1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Stx6Q9JKK1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Stx6Q9JKK1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stx6Q9JKK1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stx6Q9JKK1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Stx6Q9JKK1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms