Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp39a1Q9JKJ9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp39a1Q9JKJ9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp39a1Q9JKJ9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyp39a1Q9JKJ9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp39a1Q9JKJ9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp39a1Q9JKJ9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp39a1Q9JKJ9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp39a1Q9JKJ9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp39a1Q9JKJ9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp39a1Q9JKJ9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms