Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ybx3Q9JKB3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ybx3Q9JKB3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ybx3Q9JKB3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ybx3Q9JKB3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ybx3Q9JKB3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ybx3Q9JKB3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ybx3Q9JKB3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ybx3Q9JKB3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ybx3Q9JKB3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Ybx3Q9JKB3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ybx3Q9JKB3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ybx3Q9JKB3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ybx3Q9JKB3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Ybx3Q9JKB3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ybx3Q9JKB3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ybx3Q9JKB3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ybx3Q9JKB3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ybx3Q9JKB3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ybx3Q9JKB3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ybx3Q9JKB3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Ybx3Q9JKB3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ybx3Q9JKB3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ybx3Q9JKB3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Ybx3Q9JKB3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ybx3Q9JKB3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ybx3Q9JKB3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ybx3Q9JKB3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ybx3Q9JKB3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Ybx3Q9JKB3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Ybx3Q9JKB3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ybx3Q9JKB3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ybx3Q9JKB3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ybx3Q9JKB3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ybx3Q9JKB3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ybx3Q9JKB3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ybx3Q9JKB3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ybx3Q9JKB3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ybx3Q9JKB3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ybx3Q9JKB3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ybx3Q9JKB3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ybx3Q9JKB3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ybx3Q9JKB3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ybx3Q9JKB3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ybx3Q9JKB3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ybx3Q9JKB3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ybx3Q9JKB3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ybx3Q9JKB3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ybx3Q9JKB3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ybx3Q9JKB3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ybx3Q9JKB3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Ybx3Q9JKB3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Ybx3Q9JKB3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ybx3Q9JKB3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ybx3Q9JKB3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ybx3Q9JKB3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ybx3Q9JKB3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Ybx3Q9JKB3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ybx3Q9JKB3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ybx3Q9JKB3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ybx3Q9JKB3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Ybx3Q9JKB3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ybx3Q9JKB3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ybx3Q9JKB3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ybx3Q9JKB3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ybx3Q9JKB3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ybx3Q9JKB3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ybx3Q9JKB3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ybx3Q9JKB3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ybx3Q9JKB3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Ybx3Q9JKB3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ybx3Q9JKB3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ybx3Q9JKB3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ybx3Q9JKB3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ybx3Q9JKB3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ybx3Q9JKB3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ybx3Q9JKB3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Ybx3Q9JKB3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ybx3Q9JKB3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ybx3Q9JKB3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ybx3Q9JKB3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ybx3Q9JKB3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Ybx3Q9JKB3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ybx3Q9JKB3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ybx3Q9JKB3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ybx3Q9JKB3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ybx3Q9JKB3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ybx3Q9JKB3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ybx3Q9JKB3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Ybx3Q9JKB3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ybx3Q9JKB3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ybx3Q9JKB3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ybx3Q9JKB3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ybx3Q9JKB3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ybx3Q9JKB3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ybx3Q9JKB3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ybx3Q9JKB3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ybx3Q9JKB3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ybx3Q9JKB3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms