Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pard6bQ9JK83 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pard6bQ9JK83 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pard6bQ9JK83 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pard6bQ9JK83 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pard6bQ9JK83 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pard6bQ9JK83 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pard6bQ9JK83 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pard6bQ9JK83 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pard6bQ9JK83 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pard6bQ9JK83 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pard6bQ9JK83 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pard6bQ9JK83 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pard6bQ9JK83 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pard6bQ9JK83 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pard6bQ9JK83 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pard6bQ9JK83 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pard6bQ9JK83 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pard6bQ9JK83 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pard6bQ9JK83 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pard6bQ9JK83 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pard6bQ9JK83 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pard6bQ9JK83 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pard6bQ9JK83 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pard6bQ9JK83 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pard6bQ9JK83 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pard6bQ9JK83 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pard6bQ9JK83 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pard6bQ9JK83 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pard6bQ9JK83 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pard6bQ9JK83 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pard6bQ9JK83 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pard6bQ9JK83 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pard6bQ9JK83 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pard6bQ9JK83 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pard6bQ9JK83 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pard6bQ9JK83 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pard6bQ9JK83 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pard6bQ9JK83 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pard6bQ9JK83 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pard6bQ9JK83 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pard6bQ9JK83 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pard6bQ9JK83 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pard6bQ9JK83 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pard6bQ9JK83 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pard6bQ9JK83 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pard6bQ9JK83 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pard6bQ9JK83 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pard6bQ9JK83 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pard6bQ9JK83 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pard6bQ9JK83 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pard6bQ9JK83 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pard6bQ9JK83 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pard6bQ9JK83 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pard6bQ9JK83 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pard6bQ9JK83 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pard6bQ9JK83 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pard6bQ9JK83 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pard6bQ9JK83 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pard6bQ9JK83 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pard6bQ9JK83 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pard6bQ9JK83 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pard6bQ9JK83 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pard6bQ9JK83 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pard6bQ9JK83 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pard6bQ9JK83 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pard6bQ9JK83 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pard6bQ9JK83 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pard6bQ9JK83 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pard6bQ9JK83 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pard6bQ9JK83 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pard6bQ9JK83 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pard6bQ9JK83 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pard6bQ9JK83 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pard6bQ9JK83 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pard6bQ9JK83 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pard6bQ9JK83 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pard6bQ9JK83 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pard6bQ9JK83 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pard6bQ9JK83 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pard6bQ9JK83 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pard6bQ9JK83 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pard6bQ9JK83 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pard6bQ9JK83 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pard6bQ9JK83 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pard6bQ9JK83 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pard6bQ9JK83 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms