Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG7

Caln1, Calcium-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caln1Q9JJG7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Caln1Q9JJG7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Caln1Q9JJG7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Caln1Q9JJG7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Caln1Q9JJG7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Caln1Q9JJG7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Caln1Q9JJG7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Caln1Q9JJG7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Caln1Q9JJG7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Caln1Q9JJG7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Caln1Q9JJG7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Caln1Q9JJG7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Caln1Q9JJG7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Caln1Q9JJG7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Caln1Q9JJG7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Caln1Q9JJG7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Caln1Q9JJG7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Caln1Q9JJG7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Caln1Q9JJG7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Caln1Q9JJG7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Caln1Q9JJG7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Caln1Q9JJG7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Caln1Q9JJG7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Caln1Q9JJG7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Caln1Q9JJG7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Caln1Q9JJG7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Caln1Q9JJG7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Caln1Q9JJG7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Caln1Q9JJG7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Caln1Q9JJG7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Caln1Q9JJG7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Caln1Q9JJG7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Caln1Q9JJG7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Caln1Q9JJG7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Caln1Q9JJG7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Caln1Q9JJG7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Caln1Q9JJG7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Caln1Q9JJG7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Caln1Q9JJG7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Caln1Q9JJG7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Caln1Q9JJG7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Caln1Q9JJG7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Caln1Q9JJG7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Caln1Q9JJG7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Caln1Q9JJG7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Caln1Q9JJG7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Caln1Q9JJG7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Caln1Q9JJG7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Caln1Q9JJG7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Caln1Q9JJG7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Caln1Q9JJG7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Caln1Q9JJG7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Caln1Q9JJG7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Caln1Q9JJG7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Caln1Q9JJG7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Caln1Q9JJG7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Caln1Q9JJG7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Caln1Q9JJG7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Caln1Q9JJG7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Caln1Q9JJG7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Caln1Q9JJG7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Caln1Q9JJG7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Caln1Q9JJG7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Caln1Q9JJG7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Caln1Q9JJG7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Caln1Q9JJG7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Caln1Q9JJG7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Caln1Q9JJG7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Caln1Q9JJG7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Caln1Q9JJG7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Caln1Q9JJG7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Caln1Q9JJG7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Caln1Q9JJG7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Caln1Q9JJG7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Caln1Q9JJG7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Caln1Q9JJG7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Caln1Q9JJG7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Caln1Q9JJG7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Caln1Q9JJG7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Caln1Q9JJG7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Caln1Q9JJG7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Caln1Q9JJG7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Caln1Q9JJG7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Caln1Q9JJG7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Caln1Q9JJG7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Caln1Q9JJG7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Caln1Q9JJG7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Caln1Q9JJG7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Caln1Q9JJG7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Caln1Q9JJG7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Caln1Q9JJG7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Caln1Q9JJG7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Caln1Q9JJG7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Caln1Q9JJG7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Caln1Q9JJG7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Caln1Q9JJG7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Caln1Q9JJG7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Caln1Q9JJG7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Caln1Q9JJG7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Caln1Q9JJG7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms