Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Riox1Q9JJF3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Riox1Q9JJF3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Riox1Q9JJF3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Riox1Q9JJF3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riox1Q9JJF3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riox1Q9JJF3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riox1Q9JJF3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riox1Q9JJF3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riox1Q9JJF3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riox1Q9JJF3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riox1Q9JJF3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Riox1Q9JJF3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Riox1Q9JJF3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Riox1Q9JJF3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Riox1Q9JJF3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Riox1Q9JJF3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Riox1Q9JJF3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Riox1Q9JJF3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Riox1Q9JJF3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Riox1Q9JJF3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Riox1Q9JJF3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Riox1Q9JJF3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Riox1Q9JJF3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Riox1Q9JJF3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
Riox1Q9JJF3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Riox1Q9JJF3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Riox1Q9JJF3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Riox1Q9JJF3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Riox1Q9JJF3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Riox1Q9JJF3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riox1Q9JJF3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riox1Q9JJF3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riox1Q9JJF3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riox1Q9JJF3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riox1Q9JJF3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Riox1Q9JJF3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riox1Q9JJF3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riox1Q9JJF3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riox1Q9JJF3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riox1Q9JJF3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riox1Q9JJF3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riox1Q9JJF3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riox1Q9JJF3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riox1Q9JJF3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riox1Q9JJF3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riox1Q9JJF3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riox1Q9JJF3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riox1Q9JJF3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riox1Q9JJF3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Riox1Q9JJF3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riox1Q9JJF3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Riox1Q9JJF3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Riox1Q9JJF3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Riox1Q9JJF3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Riox1Q9JJF3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Riox1Q9JJF3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Riox1Q9JJF3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Riox1Q9JJF3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Riox1Q9JJF3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Riox1Q9JJF3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Riox1Q9JJF3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riox1Q9JJF3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riox1Q9JJF3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riox1Q9JJF3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Riox1Q9JJF3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Riox1Q9JJF3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Riox1Q9JJF3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Riox1Q9JJF3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Riox1Q9JJF3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Riox1Q9JJF3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms