Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ercc6l2Q9JIM3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Ercc6l2Q9JIM3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
Ercc6l2Q9JIM3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ercc6l2Q9JIM3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ercc6l2Q9JIM3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ercc6l2Q9JIM3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ercc6l2Q9JIM3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ercc6l2Q9JIM3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Ercc6l2Q9JIM3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ercc6l2Q9JIM3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ercc6l2Q9JIM3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ercc6l2Q9JIM3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ercc6l2Q9JIM3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ercc6l2Q9JIM3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ercc6l2Q9JIM3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ercc6l2Q9JIM3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ercc6l2Q9JIM3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ercc6l2Q9JIM3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ercc6l2Q9JIM3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ercc6l2Q9JIM3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ercc6l2Q9JIM3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ercc6l2Q9JIM3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ercc6l2Q9JIM3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ercc6l2Q9JIM3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ercc6l2Q9JIM3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ercc6l2Q9JIM3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ercc6l2Q9JIM3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ercc6l2Q9JIM3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ercc6l2Q9JIM3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ercc6l2Q9JIM3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ercc6l2Q9JIM3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ercc6l2Q9JIM3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ercc6l2Q9JIM3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ercc6l2Q9JIM3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ercc6l2Q9JIM3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ercc6l2Q9JIM3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ercc6l2Q9JIM3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ercc6l2Q9JIM3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ercc6l2Q9JIM3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ercc6l2Q9JIM3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ercc6l2Q9JIM3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Ercc6l2Q9JIM3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ercc6l2Q9JIM3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ercc6l2Q9JIM3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ercc6l2Q9JIM3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Ercc6l2Q9JIM3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Ercc6l2Q9JIM3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Ercc6l2Q9JIM3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ercc6l2Q9JIM3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ercc6l2Q9JIM3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ercc6l2Q9JIM3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ercc6l2Q9JIM3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ercc6l2Q9JIM3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ercc6l2Q9JIM3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Ercc6l2Q9JIM3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ercc6l2Q9JIM3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Ercc6l2Q9JIM3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ercc6l2Q9JIM3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Ercc6l2Q9JIM3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Ercc6l2Q9JIM3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ercc6l2Q9JIM3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ercc6l2Q9JIM3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ercc6l2Q9JIM3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ercc6l2Q9JIM3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Ercc6l2Q9JIM3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.18
Ercc6l2Q9JIM3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ercc6l2Q9JIM3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ercc6l2Q9JIM3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ercc6l2Q9JIM3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ercc6l2Q9JIM3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ercc6l2Q9JIM3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ercc6l2Q9JIM3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ercc6l2Q9JIM3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ercc6l2Q9JIM3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ercc6l2Q9JIM3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ercc6l2Q9JIM3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ercc6l2Q9JIM3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Ercc6l2Q9JIM3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ercc6l2Q9JIM3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ercc6l2Q9JIM3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Ercc6l2Q9JIM3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms