Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl28Q9JIL2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccl28Q9JIL2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccl28Q9JIL2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccl28Q9JIL2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccl28Q9JIL2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccl28Q9JIL2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccl28Q9JIL2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccl28Q9JIL2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccl28Q9JIL2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccl28Q9JIL2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccl28Q9JIL2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccl28Q9JIL2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccl28Q9JIL2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccl28Q9JIL2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccl28Q9JIL2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccl28Q9JIL2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccl28Q9JIL2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccl28Q9JIL2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccl28Q9JIL2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccl28Q9JIL2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccl28Q9JIL2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccl28Q9JIL2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccl28Q9JIL2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccl28Q9JIL2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccl28Q9JIL2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccl28Q9JIL2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccl28Q9JIL2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccl28Q9JIL2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccl28Q9JIL2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccl28Q9JIL2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccl28Q9JIL2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccl28Q9JIL2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccl28Q9JIL2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccl28Q9JIL2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccl28Q9JIL2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl28Q9JIL2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl28Q9JIL2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl28Q9JIL2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl28Q9JIL2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl28Q9JIL2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl28Q9JIL2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl28Q9JIL2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl28Q9JIL2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl28Q9JIL2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl28Q9JIL2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl28Q9JIL2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl28Q9JIL2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl28Q9JIL2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl28Q9JIL2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl28Q9JIL2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl28Q9JIL2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl28Q9JIL2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl28Q9JIL2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl28Q9JIL2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccl28Q9JIL2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccl28Q9JIL2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccl28Q9JIL2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl28Q9JIL2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl28Q9JIL2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl28Q9JIL2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl28Q9JIL2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl28Q9JIL2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccl28Q9JIL2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccl28Q9JIL2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccl28Q9JIL2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccl28Q9JIL2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccl28Q9JIL2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccl28Q9JIL2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccl28Q9JIL2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccl28Q9JIL2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccl28Q9JIL2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccl28Q9JIL2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccl28Q9JIL2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccl28Q9JIL2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccl28Q9JIL2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccl28Q9JIL2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccl28Q9JIL2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccl28Q9JIL2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccl28Q9JIL2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccl28Q9JIL2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccl28Q9JIL2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms