Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI13

Utp3, Something about silencing protein 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp3Q9JI13 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Utp3Q9JI13 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Utp3Q9JI13 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Utp3Q9JI13 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Utp3Q9JI13 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Utp3Q9JI13 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Utp3Q9JI13 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Utp3Q9JI13 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Utp3Q9JI13 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Utp3Q9JI13 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Utp3Q9JI13 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Utp3Q9JI13 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Utp3Q9JI13 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Utp3Q9JI13 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Utp3Q9JI13 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Utp3Q9JI13 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Utp3Q9JI13 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Utp3Q9JI13 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Utp3Q9JI13 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Utp3Q9JI13 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Utp3Q9JI13 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Utp3Q9JI13 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Utp3Q9JI13 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Utp3Q9JI13 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Utp3Q9JI13 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Utp3Q9JI13 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Utp3Q9JI13 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Utp3Q9JI13 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Utp3Q9JI13 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Utp3Q9JI13 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Utp3Q9JI13 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Utp3Q9JI13 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Utp3Q9JI13 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Utp3Q9JI13 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Utp3Q9JI13 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Utp3Q9JI13 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Utp3Q9JI13 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Utp3Q9JI13 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Utp3Q9JI13 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Utp3Q9JI13 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Utp3Q9JI13 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Utp3Q9JI13 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Utp3Q9JI13 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Utp3Q9JI13 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Utp3Q9JI13 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Utp3Q9JI13 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Utp3Q9JI13 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Utp3Q9JI13 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Utp3Q9JI13 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Utp3Q9JI13 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Utp3Q9JI13 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Utp3Q9JI13 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Utp3Q9JI13 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Utp3Q9JI13 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Utp3Q9JI13 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Utp3Q9JI13 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Utp3Q9JI13 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Utp3Q9JI13 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Utp3Q9JI13 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Utp3Q9JI13 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Utp3Q9JI13 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Utp3Q9JI13 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Utp3Q9JI13 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Utp3Q9JI13 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Utp3Q9JI13 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Utp3Q9JI13 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Utp3Q9JI13 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Utp3Q9JI13 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Utp3Q9JI13 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Utp3Q9JI13 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Utp3Q9JI13 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Utp3Q9JI13 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Utp3Q9JI13 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Utp3Q9JI13 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Utp3Q9JI13 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Utp3Q9JI13 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Utp3Q9JI13 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Utp3Q9JI13 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Utp3Q9JI13 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Utp3Q9JI13 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Utp3Q9JI13 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Utp3Q9JI13 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Utp3Q9JI13 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Utp3Q9JI13 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Utp3Q9JI13 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Utp3Q9JI13 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Utp3Q9JI13 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Utp3Q9JI13 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Utp3Q9JI13 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Utp3Q9JI13 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Utp3Q9JI13 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Utp3Q9JI13 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Utp3Q9JI13 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Utp3Q9JI13 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Utp3Q9JI13 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Utp3Q9JI13 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Utp3Q9JI13 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Utp3Q9JI13 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Utp3Q9JI13 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Utp3Q9JI13 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms