Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cldn12Q9ET43 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cldn12Q9ET43 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cldn12Q9ET43 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cldn12Q9ET43 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cldn12Q9ET43 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cldn12Q9ET43 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn12Q9ET43 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn12Q9ET43 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn12Q9ET43 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn12Q9ET43 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn12Q9ET43 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn12Q9ET43 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn12Q9ET43 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn12Q9ET43 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn12Q9ET43 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn12Q9ET43 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn12Q9ET43 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn12Q9ET43 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn12Q9ET43 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn12Q9ET43 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn12Q9ET43 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn12Q9ET43 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn12Q9ET43 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn12Q9ET43 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn12Q9ET43 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn12Q9ET43 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn12Q9ET43 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn12Q9ET43 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn12Q9ET43 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn12Q9ET43 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn12Q9ET43 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn12Q9ET43 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn12Q9ET43 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn12Q9ET43 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn12Q9ET43 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn12Q9ET43 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn12Q9ET43 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn12Q9ET43 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn12Q9ET43 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn12Q9ET43 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn12Q9ET43 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn12Q9ET43 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn12Q9ET43 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn12Q9ET43 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn12Q9ET43 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn12Q9ET43 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn12Q9ET43 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn12Q9ET43 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn12Q9ET43 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn12Q9ET43 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn12Q9ET43 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn12Q9ET43 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cldn12Q9ET43 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn12Q9ET43 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn12Q9ET43 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn12Q9ET43 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn12Q9ET43 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn12Q9ET43 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn12Q9ET43 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn12Q9ET43 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn12Q9ET43 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn12Q9ET43 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn12Q9ET43 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn12Q9ET43 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn12Q9ET43 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn12Q9ET43 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn12Q9ET43 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn12Q9ET43 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms