Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf13bQ9ET35 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf13bQ9ET35 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfrsf13bQ9ET35 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfrsf13bQ9ET35 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfrsf13bQ9ET35 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfrsf13bQ9ET35 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfrsf13bQ9ET35 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfrsf13bQ9ET35 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfrsf13bQ9ET35 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfrsf13bQ9ET35 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf13bQ9ET35 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf13bQ9ET35 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf13bQ9ET35 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf13bQ9ET35 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf13bQ9ET35 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf13bQ9ET35 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf13bQ9ET35 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf13bQ9ET35 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf13bQ9ET35 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms