Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ube3bQ9ES34 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ube3bQ9ES34 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ube3bQ9ES34 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ube3bQ9ES34 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ube3bQ9ES34 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ube3bQ9ES34 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ube3bQ9ES34 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ube3bQ9ES34 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ube3bQ9ES34 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ube3bQ9ES34 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ube3bQ9ES34 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ube3bQ9ES34 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ube3bQ9ES34 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ube3bQ9ES34 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ube3bQ9ES34 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ube3bQ9ES34 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ube3bQ9ES34 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ube3bQ9ES34 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ube3bQ9ES34 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ube3bQ9ES34 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ube3bQ9ES34 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ube3bQ9ES34 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ube3bQ9ES34 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ube3bQ9ES34 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ube3bQ9ES34 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ube3bQ9ES34 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ube3bQ9ES34 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ube3bQ9ES34 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ube3bQ9ES34 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ube3bQ9ES34 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ube3bQ9ES34 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ube3bQ9ES34 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ube3bQ9ES34 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ube3bQ9ES34 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ube3bQ9ES34 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ube3bQ9ES34 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ube3bQ9ES34 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ube3bQ9ES34 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ube3bQ9ES34 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ube3bQ9ES34 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ube3bQ9ES34 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ube3bQ9ES34 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ube3bQ9ES34 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ube3bQ9ES34 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ube3bQ9ES34 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ube3bQ9ES34 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ube3bQ9ES34 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ube3bQ9ES34 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ube3bQ9ES34 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ube3bQ9ES34 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ube3bQ9ES34 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ube3bQ9ES34 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ube3bQ9ES34 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ube3bQ9ES34 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ube3bQ9ES34 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ube3bQ9ES34 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ube3bQ9ES34 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ube3bQ9ES34 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ube3bQ9ES34 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ube3bQ9ES34 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ube3bQ9ES34 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ube3bQ9ES34 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ube3bQ9ES34 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ube3bQ9ES34 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ube3bQ9ES34 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ube3bQ9ES34 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ube3bQ9ES34 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ube3bQ9ES34 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ube3bQ9ES34 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ube3bQ9ES34 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ube3bQ9ES34 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ube3bQ9ES34 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ube3bQ9ES34 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ube3bQ9ES34 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ube3bQ9ES34 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ube3bQ9ES34 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ube3bQ9ES34 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ube3bQ9ES34 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ube3bQ9ES34 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ube3bQ9ES34 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ube3bQ9ES34 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ube3bQ9ES34 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ube3bQ9ES34 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ube3bQ9ES34 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ube3bQ9ES34 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ube3bQ9ES34 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Ube3bQ9ES34 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ube3bQ9ES34 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ube3bQ9ES34 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ube3bQ9ES34 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ube3bQ9ES34 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ube3bQ9ES34 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ube3bQ9ES34 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ube3bQ9ES34 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ube3bQ9ES34 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ube3bQ9ES34 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ube3bQ9ES34 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ube3bQ9ES34 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ube3bQ9ES34 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms