Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERZ3

Chrm3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm3Q9ERZ3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrm3Q9ERZ3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrm3Q9ERZ3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrm3Q9ERZ3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrm3Q9ERZ3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrm3Q9ERZ3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrm3Q9ERZ3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrm3Q9ERZ3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrm3Q9ERZ3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrm3Q9ERZ3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrm3Q9ERZ3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrm3Q9ERZ3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrm3Q9ERZ3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrm3Q9ERZ3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrm3Q9ERZ3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrm3Q9ERZ3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrm3Q9ERZ3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrm3Q9ERZ3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrm3Q9ERZ3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrm3Q9ERZ3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrm3Q9ERZ3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrm3Q9ERZ3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrm3Q9ERZ3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrm3Q9ERZ3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrm3Q9ERZ3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrm3Q9ERZ3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrm3Q9ERZ3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chrm3Q9ERZ3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrm3Q9ERZ3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrm3Q9ERZ3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrm3Q9ERZ3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrm3Q9ERZ3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrm3Q9ERZ3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrm3Q9ERZ3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrm3Q9ERZ3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrm3Q9ERZ3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrm3Q9ERZ3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrm3Q9ERZ3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrm3Q9ERZ3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrm3Q9ERZ3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrm3Q9ERZ3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrm3Q9ERZ3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrm3Q9ERZ3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrm3Q9ERZ3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrm3Q9ERZ3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrm3Q9ERZ3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrm3Q9ERZ3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrm3Q9ERZ3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrm3Q9ERZ3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrm3Q9ERZ3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chrm3Q9ERZ3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrm3Q9ERZ3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrm3Q9ERZ3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrm3Q9ERZ3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrm3Q9ERZ3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrm3Q9ERZ3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrm3Q9ERZ3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrm3Q9ERZ3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrm3Q9ERZ3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrm3Q9ERZ3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrm3Q9ERZ3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrm3Q9ERZ3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrm3Q9ERZ3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrm3Q9ERZ3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrm3Q9ERZ3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrm3Q9ERZ3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrm3Q9ERZ3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrm3Q9ERZ3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrm3Q9ERZ3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrm3Q9ERZ3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrm3Q9ERZ3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrm3Q9ERZ3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrm3Q9ERZ3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrm3Q9ERZ3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrm3Q9ERZ3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrm3Q9ERZ3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrm3Q9ERZ3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrm3Q9ERZ3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrm3Q9ERZ3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrm3Q9ERZ3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrm3Q9ERZ3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrm3Q9ERZ3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrm3Q9ERZ3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrm3Q9ERZ3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrm3Q9ERZ3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrm3Q9ERZ3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrm3Q9ERZ3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrm3Q9ERZ3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrm3Q9ERZ3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrm3Q9ERZ3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrm3Q9ERZ3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrm3Q9ERZ3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrm3Q9ERZ3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrm3Q9ERZ3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrm3Q9ERZ3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrm3Q9ERZ3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrm3Q9ERZ3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chrm3Q9ERZ3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chrm3Q9ERZ3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrm3Q9ERZ3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms