Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hipk3Q9ERH7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hipk3Q9ERH7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hipk3Q9ERH7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hipk3Q9ERH7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hipk3Q9ERH7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hipk3Q9ERH7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hipk3Q9ERH7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hipk3Q9ERH7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hipk3Q9ERH7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hipk3Q9ERH7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hipk3Q9ERH7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hipk3Q9ERH7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hipk3Q9ERH7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hipk3Q9ERH7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hipk3Q9ERH7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hipk3Q9ERH7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hipk3Q9ERH7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hipk3Q9ERH7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hipk3Q9ERH7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hipk3Q9ERH7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hipk3Q9ERH7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hipk3Q9ERH7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hipk3Q9ERH7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hipk3Q9ERH7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hipk3Q9ERH7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hipk3Q9ERH7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hipk3Q9ERH7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hipk3Q9ERH7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hipk3Q9ERH7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hipk3Q9ERH7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hipk3Q9ERH7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hipk3Q9ERH7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hipk3Q9ERH7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hipk3Q9ERH7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hipk3Q9ERH7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hipk3Q9ERH7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hipk3Q9ERH7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hipk3Q9ERH7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hipk3Q9ERH7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hipk3Q9ERH7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hipk3Q9ERH7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hipk3Q9ERH7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hipk3Q9ERH7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hipk3Q9ERH7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hipk3Q9ERH7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hipk3Q9ERH7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hipk3Q9ERH7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hipk3Q9ERH7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hipk3Q9ERH7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hipk3Q9ERH7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hipk3Q9ERH7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hipk3Q9ERH7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hipk3Q9ERH7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hipk3Q9ERH7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hipk3Q9ERH7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hipk3Q9ERH7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hipk3Q9ERH7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hipk3Q9ERH7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hipk3Q9ERH7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hipk3Q9ERH7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hipk3Q9ERH7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hipk3Q9ERH7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hipk3Q9ERH7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hipk3Q9ERH7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hipk3Q9ERH7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hipk3Q9ERH7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hipk3Q9ERH7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hipk3Q9ERH7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hipk3Q9ERH7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hipk3Q9ERH7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hipk3Q9ERH7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hipk3Q9ERH7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hipk3Q9ERH7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hipk3Q9ERH7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hipk3Q9ERH7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hipk3Q9ERH7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hipk3Q9ERH7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hipk3Q9ERH7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hipk3Q9ERH7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hipk3Q9ERH7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hipk3Q9ERH7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hipk3Q9ERH7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hipk3Q9ERH7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hipk3Q9ERH7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hipk3Q9ERH7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hipk3Q9ERH7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hipk3Q9ERH7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hipk3Q9ERH7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hipk3Q9ERH7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hipk3Q9ERH7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hipk3Q9ERH7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hipk3Q9ERH7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hipk3Q9ERH7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hipk3Q9ERH7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hipk3Q9ERH7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hipk3Q9ERH7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hipk3Q9ERH7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hipk3Q9ERH7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hipk3Q9ERH7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms