Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sall1Q9ER74 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sall1Q9ER74 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Sall1Q9ER74 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sall1Q9ER74 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Sall1Q9ER74 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Sall1Q9ER74 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Sall1Q9ER74 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sall1Q9ER74 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sall1Q9ER74 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sall1Q9ER74 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sall1Q9ER74 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Sall1Q9ER74 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Sall1Q9ER74 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Sall1Q9ER74 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sall1Q9ER74 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sall1Q9ER74 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sall1Q9ER74 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sall1Q9ER74 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sall1Q9ER74 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sall1Q9ER74 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sall1Q9ER74 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sall1Q9ER74 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sall1Q9ER74 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sall1Q9ER74 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sall1Q9ER74 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sall1Q9ER74 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sall1Q9ER74 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sall1Q9ER74 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sall1Q9ER74 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sall1Q9ER74 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sall1Q9ER74 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sall1Q9ER74 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sall1Q9ER74 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sall1Q9ER74 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sall1Q9ER74 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sall1Q9ER74 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sall1Q9ER74 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sall1Q9ER74 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sall1Q9ER74 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Sall1Q9ER74 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sall1Q9ER74 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sall1Q9ER74 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sall1Q9ER74 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sall1Q9ER74 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sall1Q9ER74 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Sall1Q9ER74 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sall1Q9ER74 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sall1Q9ER74 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sall1Q9ER74 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sall1Q9ER74 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sall1Q9ER74 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sall1Q9ER74 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sall1Q9ER74 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sall1Q9ER74 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sall1Q9ER74 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sall1Q9ER74 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sall1Q9ER74 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sall1Q9ER74 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sall1Q9ER74 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sall1Q9ER74 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sall1Q9ER74 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sall1Q9ER74 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sall1Q9ER74 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sall1Q9ER74 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sall1Q9ER74 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sall1Q9ER74 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sall1Q9ER74 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sall1Q9ER74 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sall1Q9ER74 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sall1Q9ER74 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sall1Q9ER74 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sall1Q9ER74 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sall1Q9ER74 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sall1Q9ER74 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Sall1Q9ER74 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sall1Q9ER74 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sall1Q9ER74 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sall1Q9ER74 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sall1Q9ER74 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sall1Q9ER74 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sall1Q9ER74 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sall1Q9ER74 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sall1Q9ER74 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sall1Q9ER74 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sall1Q9ER74 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sall1Q9ER74 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sall1Q9ER74 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Sall1Q9ER74 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sall1Q9ER74 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sall1Q9ER74 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sall1Q9ER74 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sall1Q9ER74 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sall1Q9ER74 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sall1Q9ER74 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sall1Q9ER74 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sall1Q9ER74 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sall1Q9ER74 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sall1Q9ER74 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sall1Q9ER74 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms