Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ7

Rims2, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims2Q9EQZ7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rims2Q9EQZ7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Rims2Q9EQZ7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rims2Q9EQZ7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Rims2Q9EQZ7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rims2Q9EQZ7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rims2Q9EQZ7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rims2Q9EQZ7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Rims2Q9EQZ7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rims2Q9EQZ7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Rims2Q9EQZ7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rims2Q9EQZ7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rims2Q9EQZ7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rims2Q9EQZ7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rims2Q9EQZ7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rims2Q9EQZ7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rims2Q9EQZ7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rims2Q9EQZ7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rims2Q9EQZ7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rims2Q9EQZ7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rims2Q9EQZ7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rims2Q9EQZ7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rims2Q9EQZ7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rims2Q9EQZ7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rims2Q9EQZ7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rims2Q9EQZ7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rims2Q9EQZ7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rims2Q9EQZ7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rims2Q9EQZ7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rims2Q9EQZ7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Rims2Q9EQZ7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Rims2Q9EQZ7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rims2Q9EQZ7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rims2Q9EQZ7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rims2Q9EQZ7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rims2Q9EQZ7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rims2Q9EQZ7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rims2Q9EQZ7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Rims2Q9EQZ7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rims2Q9EQZ7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Rims2Q9EQZ7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Rims2Q9EQZ7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Rims2Q9EQZ7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rims2Q9EQZ7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rims2Q9EQZ7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Rims2Q9EQZ7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Rims2Q9EQZ7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rims2Q9EQZ7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rims2Q9EQZ7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Rims2Q9EQZ7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Rims2Q9EQZ7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rims2Q9EQZ7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rims2Q9EQZ7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rims2Q9EQZ7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rims2Q9EQZ7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rims2Q9EQZ7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rims2Q9EQZ7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Rims2Q9EQZ7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rims2Q9EQZ7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rims2Q9EQZ7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rims2Q9EQZ7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rims2Q9EQZ7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rims2Q9EQZ7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rims2Q9EQZ7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rims2Q9EQZ7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rims2Q9EQZ7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rims2Q9EQZ7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rims2Q9EQZ7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rims2Q9EQZ7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rims2Q9EQZ7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Rims2Q9EQZ7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rims2Q9EQZ7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Rims2Q9EQZ7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rims2Q9EQZ7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Rims2Q9EQZ7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rims2Q9EQZ7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rims2Q9EQZ7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Rims2Q9EQZ7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rims2Q9EQZ7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rims2Q9EQZ7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rims2Q9EQZ7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rims2Q9EQZ7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Rims2Q9EQZ7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rims2Q9EQZ7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rims2Q9EQZ7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rims2Q9EQZ7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rims2Q9EQZ7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Rims2Q9EQZ7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Rims2Q9EQZ7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rims2Q9EQZ7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rims2Q9EQZ7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rims2Q9EQZ7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rims2Q9EQZ7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rims2Q9EQZ7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rims2Q9EQZ7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rims2Q9EQZ7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rims2Q9EQZ7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rims2Q9EQZ7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rims2Q9EQZ7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rims2Q9EQZ7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms