Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM6

Dgcr8, Microprocessor complex subunit DGCR8, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr8Q9EQM6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dgcr8Q9EQM6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dgcr8Q9EQM6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dgcr8Q9EQM6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dgcr8Q9EQM6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dgcr8Q9EQM6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dgcr8Q9EQM6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dgcr8Q9EQM6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dgcr8Q9EQM6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dgcr8Q9EQM6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dgcr8Q9EQM6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dgcr8Q9EQM6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dgcr8Q9EQM6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dgcr8Q9EQM6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dgcr8Q9EQM6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dgcr8Q9EQM6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dgcr8Q9EQM6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dgcr8Q9EQM6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dgcr8Q9EQM6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Dgcr8Q9EQM6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dgcr8Q9EQM6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dgcr8Q9EQM6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dgcr8Q9EQM6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dgcr8Q9EQM6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dgcr8Q9EQM6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dgcr8Q9EQM6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dgcr8Q9EQM6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dgcr8Q9EQM6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dgcr8Q9EQM6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dgcr8Q9EQM6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dgcr8Q9EQM6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dgcr8Q9EQM6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dgcr8Q9EQM6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dgcr8Q9EQM6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dgcr8Q9EQM6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dgcr8Q9EQM6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dgcr8Q9EQM6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dgcr8Q9EQM6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dgcr8Q9EQM6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dgcr8Q9EQM6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dgcr8Q9EQM6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dgcr8Q9EQM6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dgcr8Q9EQM6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dgcr8Q9EQM6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dgcr8Q9EQM6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dgcr8Q9EQM6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dgcr8Q9EQM6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dgcr8Q9EQM6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dgcr8Q9EQM6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dgcr8Q9EQM6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dgcr8Q9EQM6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dgcr8Q9EQM6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dgcr8Q9EQM6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dgcr8Q9EQM6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Dgcr8Q9EQM6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dgcr8Q9EQM6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dgcr8Q9EQM6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Dgcr8Q9EQM6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dgcr8Q9EQM6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dgcr8Q9EQM6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dgcr8Q9EQM6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Dgcr8Q9EQM6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Dgcr8Q9EQM6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dgcr8Q9EQM6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dgcr8Q9EQM6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dgcr8Q9EQM6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dgcr8Q9EQM6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dgcr8Q9EQM6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dgcr8Q9EQM6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dgcr8Q9EQM6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dgcr8Q9EQM6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dgcr8Q9EQM6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dgcr8Q9EQM6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dgcr8Q9EQM6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dgcr8Q9EQM6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dgcr8Q9EQM6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dgcr8Q9EQM6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dgcr8Q9EQM6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dgcr8Q9EQM6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dgcr8Q9EQM6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dgcr8Q9EQM6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dgcr8Q9EQM6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dgcr8Q9EQM6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dgcr8Q9EQM6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dgcr8Q9EQM6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dgcr8Q9EQM6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dgcr8Q9EQM6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dgcr8Q9EQM6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dgcr8Q9EQM6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dgcr8Q9EQM6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dgcr8Q9EQM6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dgcr8Q9EQM6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dgcr8Q9EQM6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dgcr8Q9EQM6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dgcr8Q9EQM6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dgcr8Q9EQM6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Dgcr8Q9EQM6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dgcr8Q9EQM6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dgcr8Q9EQM6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dgcr8Q9EQM6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms