Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB94

Wdr53, WD repeat-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr53Q9DB94 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr53Q9DB94 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr53Q9DB94 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr53Q9DB94 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr53Q9DB94 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr53Q9DB94 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr53Q9DB94 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr53Q9DB94 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr53Q9DB94 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr53Q9DB94 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr53Q9DB94 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr53Q9DB94 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr53Q9DB94 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Wdr53Q9DB94 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Wdr53Q9DB94 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Wdr53Q9DB94 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Wdr53Q9DB94 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Wdr53Q9DB94 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr53Q9DB94 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr53Q9DB94 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr53Q9DB94 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr53Q9DB94 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr53Q9DB94 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr53Q9DB94 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr53Q9DB94 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr53Q9DB94 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr53Q9DB94 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr53Q9DB94 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr53Q9DB94 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr53Q9DB94 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr53Q9DB94 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr53Q9DB94 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr53Q9DB94 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr53Q9DB94 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr53Q9DB94 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr53Q9DB94 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr53Q9DB94 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr53Q9DB94 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr53Q9DB94 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr53Q9DB94 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr53Q9DB94 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr53Q9DB94 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wdr53Q9DB94 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wdr53Q9DB94 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wdr53Q9DB94 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wdr53Q9DB94 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr53Q9DB94 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr53Q9DB94 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Wdr53Q9DB94 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Wdr53Q9DB94 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Wdr53Q9DB94 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Wdr53Q9DB94 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wdr53Q9DB94 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wdr53Q9DB94 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr53Q9DB94 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr53Q9DB94 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr53Q9DB94 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr53Q9DB94 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr53Q9DB94 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr53Q9DB94 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr53Q9DB94 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr53Q9DB94 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr53Q9DB94 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr53Q9DB94 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr53Q9DB94 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr53Q9DB94 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr53Q9DB94 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr53Q9DB94 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr53Q9DB94 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr53Q9DB94 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr53Q9DB94 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Wdr53Q9DB94 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr53Q9DB94 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr53Q9DB94 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wdr53Q9DB94 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wdr53Q9DB94 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wdr53Q9DB94 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr53Q9DB94 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdr53Q9DB94 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdr53Q9DB94 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdr53Q9DB94 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdr53Q9DB94 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdr53Q9DB94 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdr53Q9DB94 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdr53Q9DB94 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Wdr53Q9DB94 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr53Q9DB94 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr53Q9DB94 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr53Q9DB94 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr53Q9DB94 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr53Q9DB94 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr53Q9DB94 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr53Q9DB94 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr53Q9DB94 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr53Q9DB94 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr53Q9DB94 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr53Q9DB94 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr53Q9DB94 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr53Q9DB94 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr53Q9DB94 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms