Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp5oQ9DB20 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp5oQ9DB20 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp5oQ9DB20 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp5oQ9DB20 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atp5oQ9DB20 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp5oQ9DB20 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp5oQ9DB20 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp5oQ9DB20 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp5oQ9DB20 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp5oQ9DB20 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp5oQ9DB20 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp5oQ9DB20 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp5oQ9DB20 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp5oQ9DB20 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp5oQ9DB20 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp5oQ9DB20 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp5oQ9DB20 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp5oQ9DB20 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp5oQ9DB20 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp5oQ9DB20 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp5oQ9DB20 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp5oQ9DB20 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp5oQ9DB20 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp5oQ9DB20 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp5oQ9DB20 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp5oQ9DB20 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp5oQ9DB20 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp5oQ9DB20 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp5oQ9DB20 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp5oQ9DB20 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp5oQ9DB20 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp5oQ9DB20 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp5oQ9DB20 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp5oQ9DB20 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp5oQ9DB20 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp5oQ9DB20 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp5oQ9DB20 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp5oQ9DB20 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp5oQ9DB20 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp5oQ9DB20 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp5oQ9DB20 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp5oQ9DB20 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp5oQ9DB20 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp5oQ9DB20 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp5oQ9DB20 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp5oQ9DB20 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp5oQ9DB20 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp5oQ9DB20 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp5oQ9DB20 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp5oQ9DB20 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp5oQ9DB20 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp5oQ9DB20 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp5oQ9DB20 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp5oQ9DB20 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp5oQ9DB20 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp5oQ9DB20 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp5oQ9DB20 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp5oQ9DB20 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp5oQ9DB20 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp5oQ9DB20 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp5oQ9DB20 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp5oQ9DB20 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp5oQ9DB20 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp5oQ9DB20 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp5oQ9DB20 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp5oQ9DB20 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp5oQ9DB20 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp5oQ9DB20 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp5oQ9DB20 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp5oQ9DB20 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp5oQ9DB20 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp5oQ9DB20 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp5oQ9DB20 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp5oQ9DB20 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp5oQ9DB20 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp5oQ9DB20 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp5oQ9DB20 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp5oQ9DB20 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp5oQ9DB20 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp5oQ9DB20 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp5oQ9DB20 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp5oQ9DB20 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp5oQ9DB20 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp5oQ9DB20 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp5oQ9DB20 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp5oQ9DB20 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp5oQ9DB20 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp5oQ9DB20 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp5oQ9DB20 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms