Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9I4

Tbc1d20, TBC1 domain family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d20Q9D9I4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tbc1d20Q9D9I4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tbc1d20Q9D9I4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tbc1d20Q9D9I4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tbc1d20Q9D9I4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tbc1d20Q9D9I4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tbc1d20Q9D9I4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tbc1d20Q9D9I4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tbc1d20Q9D9I4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbc1d20Q9D9I4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbc1d20Q9D9I4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbc1d20Q9D9I4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbc1d20Q9D9I4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d20Q9D9I4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d20Q9D9I4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d20Q9D9I4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbc1d20Q9D9I4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbc1d20Q9D9I4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbc1d20Q9D9I4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbc1d20Q9D9I4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbc1d20Q9D9I4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbc1d20Q9D9I4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbc1d20Q9D9I4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbc1d20Q9D9I4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tbc1d20Q9D9I4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tbc1d20Q9D9I4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tbc1d20Q9D9I4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tbc1d20Q9D9I4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tbc1d20Q9D9I4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tbc1d20Q9D9I4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbc1d20Q9D9I4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbc1d20Q9D9I4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbc1d20Q9D9I4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbc1d20Q9D9I4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbc1d20Q9D9I4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbc1d20Q9D9I4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tbc1d20Q9D9I4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tbc1d20Q9D9I4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tbc1d20Q9D9I4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tbc1d20Q9D9I4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tbc1d20Q9D9I4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tbc1d20Q9D9I4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tbc1d20Q9D9I4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tbc1d20Q9D9I4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d20Q9D9I4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d20Q9D9I4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tbc1d20Q9D9I4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tbc1d20Q9D9I4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tbc1d20Q9D9I4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tbc1d20Q9D9I4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tbc1d20Q9D9I4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tbc1d20Q9D9I4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tbc1d20Q9D9I4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tbc1d20Q9D9I4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tbc1d20Q9D9I4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tbc1d20Q9D9I4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tbc1d20Q9D9I4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tbc1d20Q9D9I4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tbc1d20Q9D9I4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tbc1d20Q9D9I4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tbc1d20Q9D9I4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tbc1d20Q9D9I4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tbc1d20Q9D9I4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tbc1d20Q9D9I4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tbc1d20Q9D9I4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tbc1d20Q9D9I4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tbc1d20Q9D9I4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tbc1d20Q9D9I4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tbc1d20Q9D9I4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tbc1d20Q9D9I4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tbc1d20Q9D9I4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tbc1d20Q9D9I4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tbc1d20Q9D9I4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tbc1d20Q9D9I4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tbc1d20Q9D9I4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tbc1d20Q9D9I4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tbc1d20Q9D9I4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tbc1d20Q9D9I4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tbc1d20Q9D9I4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tbc1d20Q9D9I4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tbc1d20Q9D9I4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tbc1d20Q9D9I4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tbc1d20Q9D9I4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tbc1d20Q9D9I4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tbc1d20Q9D9I4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tbc1d20Q9D9I4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tbc1d20Q9D9I4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tbc1d20Q9D9I4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tbc1d20Q9D9I4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tbc1d20Q9D9I4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tbc1d20Q9D9I4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tbc1d20Q9D9I4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tbc1d20Q9D9I4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tbc1d20Q9D9I4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tbc1d20Q9D9I4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tbc1d20Q9D9I4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tbc1d20Q9D9I4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tbc1d20Q9D9I4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tbc1d20Q9D9I4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tbc1d20Q9D9I4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms