Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2e2Q9D902 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2e2Q9D902 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2e2Q9D902 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2e2Q9D902 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2e2Q9D902 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2e2Q9D902 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2e2Q9D902 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2e2Q9D902 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2e2Q9D902 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2e2Q9D902 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2e2Q9D902 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2e2Q9D902 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2e2Q9D902 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2e2Q9D902 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2e2Q9D902 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2e2Q9D902 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2e2Q9D902 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2e2Q9D902 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2e2Q9D902 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2e2Q9D902 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2e2Q9D902 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2e2Q9D902 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e2Q9D902 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e2Q9D902 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e2Q9D902 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2e2Q9D902 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2e2Q9D902 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2e2Q9D902 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2e2Q9D902 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2e2Q9D902 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2e2Q9D902 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2e2Q9D902 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2e2Q9D902 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2e2Q9D902 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2e2Q9D902 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2e2Q9D902 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2e2Q9D902 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2e2Q9D902 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2e2Q9D902 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2e2Q9D902 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2e2Q9D902 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2e2Q9D902 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2e2Q9D902 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2e2Q9D902 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2e2Q9D902 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2e2Q9D902 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2e2Q9D902 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2e2Q9D902 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2e2Q9D902 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2e2Q9D902 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2e2Q9D902 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2e2Q9D902 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2e2Q9D902 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf2e2Q9D902 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf2e2Q9D902 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2e2Q9D902 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2e2Q9D902 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2e2Q9D902 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2e2Q9D902 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2e2Q9D902 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2e2Q9D902 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2e2Q9D902 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2e2Q9D902 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2e2Q9D902 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2e2Q9D902 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2e2Q9D902 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2e2Q9D902 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2e2Q9D902 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2e2Q9D902 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2e2Q9D902 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2e2Q9D902 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2e2Q9D902 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2e2Q9D902 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2e2Q9D902 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2e2Q9D902 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2e2Q9D902 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2e2Q9D902 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2e2Q9D902 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2e2Q9D902 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2e2Q9D902 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2e2Q9D902 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2e2Q9D902 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2e2Q9D902 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2e2Q9D902 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2e2Q9D902 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2e2Q9D902 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2e2Q9D902 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Gtf2e2Q9D902 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2e2Q9D902 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2e2Q9D902 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2e2Q9D902 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e2Q9D902 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e2Q9D902 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2e2Q9D902 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2e2Q9D902 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2e2Q9D902 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2e2Q9D902 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2e2Q9D902 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2e2Q9D902 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms