Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx5Q9D8U8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx5Q9D8U8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx5Q9D8U8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx5Q9D8U8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx5Q9D8U8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx5Q9D8U8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx5Q9D8U8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx5Q9D8U8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx5Q9D8U8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx5Q9D8U8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx5Q9D8U8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx5Q9D8U8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx5Q9D8U8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx5Q9D8U8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx5Q9D8U8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx5Q9D8U8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx5Q9D8U8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx5Q9D8U8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx5Q9D8U8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx5Q9D8U8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx5Q9D8U8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx5Q9D8U8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx5Q9D8U8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx5Q9D8U8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx5Q9D8U8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx5Q9D8U8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx5Q9D8U8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx5Q9D8U8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx5Q9D8U8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx5Q9D8U8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx5Q9D8U8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx5Q9D8U8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx5Q9D8U8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx5Q9D8U8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx5Q9D8U8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx5Q9D8U8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx5Q9D8U8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx5Q9D8U8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx5Q9D8U8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx5Q9D8U8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx5Q9D8U8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx5Q9D8U8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx5Q9D8U8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx5Q9D8U8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx5Q9D8U8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx5Q9D8U8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx5Q9D8U8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx5Q9D8U8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx5Q9D8U8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx5Q9D8U8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx5Q9D8U8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx5Q9D8U8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx5Q9D8U8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx5Q9D8U8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx5Q9D8U8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx5Q9D8U8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx5Q9D8U8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx5Q9D8U8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx5Q9D8U8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx5Q9D8U8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx5Q9D8U8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx5Q9D8U8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx5Q9D8U8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx5Q9D8U8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx5Q9D8U8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx5Q9D8U8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx5Q9D8U8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx5Q9D8U8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx5Q9D8U8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx5Q9D8U8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx5Q9D8U8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx5Q9D8U8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx5Q9D8U8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx5Q9D8U8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx5Q9D8U8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx5Q9D8U8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx5Q9D8U8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx5Q9D8U8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx5Q9D8U8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx5Q9D8U8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx5Q9D8U8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx5Q9D8U8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx5Q9D8U8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms