Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Derl3Q9D8K3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Derl3Q9D8K3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Derl3Q9D8K3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Derl3Q9D8K3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Derl3Q9D8K3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Derl3Q9D8K3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Derl3Q9D8K3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Derl3Q9D8K3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Derl3Q9D8K3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Derl3Q9D8K3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Derl3Q9D8K3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Derl3Q9D8K3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Derl3Q9D8K3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Derl3Q9D8K3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Derl3Q9D8K3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Derl3Q9D8K3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Derl3Q9D8K3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Derl3Q9D8K3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Derl3Q9D8K3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Derl3Q9D8K3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Derl3Q9D8K3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Derl3Q9D8K3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Derl3Q9D8K3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Derl3Q9D8K3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Derl3Q9D8K3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Derl3Q9D8K3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Derl3Q9D8K3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Derl3Q9D8K3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Derl3Q9D8K3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Derl3Q9D8K3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Derl3Q9D8K3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Derl3Q9D8K3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Derl3Q9D8K3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Derl3Q9D8K3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Derl3Q9D8K3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Derl3Q9D8K3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Derl3Q9D8K3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Derl3Q9D8K3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Derl3Q9D8K3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Derl3Q9D8K3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Derl3Q9D8K3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Derl3Q9D8K3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Derl3Q9D8K3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Derl3Q9D8K3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Derl3Q9D8K3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Derl3Q9D8K3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Derl3Q9D8K3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Derl3Q9D8K3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Derl3Q9D8K3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Derl3Q9D8K3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Derl3Q9D8K3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Derl3Q9D8K3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms