Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Capns2Q9D7J7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Capns2Q9D7J7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Capns2Q9D7J7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Capns2Q9D7J7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Capns2Q9D7J7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Capns2Q9D7J7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Capns2Q9D7J7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Capns2Q9D7J7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Capns2Q9D7J7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Capns2Q9D7J7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Capns2Q9D7J7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Capns2Q9D7J7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Capns2Q9D7J7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Capns2Q9D7J7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Capns2Q9D7J7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capns2Q9D7J7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Capns2Q9D7J7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Capns2Q9D7J7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Capns2Q9D7J7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Capns2Q9D7J7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Capns2Q9D7J7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Capns2Q9D7J7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Capns2Q9D7J7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Capns2Q9D7J7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Capns2Q9D7J7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Capns2Q9D7J7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Capns2Q9D7J7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Capns2Q9D7J7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Capns2Q9D7J7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capns2Q9D7J7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capns2Q9D7J7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Capns2Q9D7J7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Capns2Q9D7J7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Capns2Q9D7J7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Capns2Q9D7J7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Capns2Q9D7J7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capns2Q9D7J7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capns2Q9D7J7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capns2Q9D7J7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Capns2Q9D7J7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Capns2Q9D7J7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Capns2Q9D7J7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capns2Q9D7J7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Capns2Q9D7J7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capns2Q9D7J7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capns2Q9D7J7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capns2Q9D7J7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Capns2Q9D7J7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Capns2Q9D7J7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Capns2Q9D7J7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Capns2Q9D7J7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Capns2Q9D7J7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Capns2Q9D7J7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Capns2Q9D7J7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capns2Q9D7J7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capns2Q9D7J7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capns2Q9D7J7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capns2Q9D7J7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capns2Q9D7J7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Capns2Q9D7J7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capns2Q9D7J7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Capns2Q9D7J7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Capns2Q9D7J7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Capns2Q9D7J7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capns2Q9D7J7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Capns2Q9D7J7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Capns2Q9D7J7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Capns2Q9D7J7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Capns2Q9D7J7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Capns2Q9D7J7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Capns2Q9D7J7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Capns2Q9D7J7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Capns2Q9D7J7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Capns2Q9D7J7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Capns2Q9D7J7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Capns2Q9D7J7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Capns2Q9D7J7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Capns2Q9D7J7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Capns2Q9D7J7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Capns2Q9D7J7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Capns2Q9D7J7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Capns2Q9D7J7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Capns2Q9D7J7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Capns2Q9D7J7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Capns2Q9D7J7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Capns2Q9D7J7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Capns2Q9D7J7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Capns2Q9D7J7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Capns2Q9D7J7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Capns2Q9D7J7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Capns2Q9D7J7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Capns2Q9D7J7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Capns2Q9D7J7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Capns2Q9D7J7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Capns2Q9D7J7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Capns2Q9D7J7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Capns2Q9D7J7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Capns2Q9D7J7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Capns2Q9D7J7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
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