Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn23Q9D7D7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn23Q9D7D7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn23Q9D7D7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn23Q9D7D7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn23Q9D7D7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn23Q9D7D7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn23Q9D7D7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn23Q9D7D7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn23Q9D7D7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn23Q9D7D7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn23Q9D7D7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn23Q9D7D7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn23Q9D7D7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cldn23Q9D7D7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cldn23Q9D7D7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cldn23Q9D7D7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cldn23Q9D7D7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn23Q9D7D7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn23Q9D7D7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn23Q9D7D7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn23Q9D7D7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn23Q9D7D7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn23Q9D7D7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn23Q9D7D7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn23Q9D7D7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn23Q9D7D7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn23Q9D7D7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn23Q9D7D7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn23Q9D7D7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn23Q9D7D7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn23Q9D7D7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn23Q9D7D7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn23Q9D7D7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn23Q9D7D7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn23Q9D7D7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn23Q9D7D7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn23Q9D7D7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn23Q9D7D7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn23Q9D7D7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn23Q9D7D7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn23Q9D7D7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn23Q9D7D7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn23Q9D7D7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn23Q9D7D7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn23Q9D7D7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn23Q9D7D7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn23Q9D7D7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn23Q9D7D7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn23Q9D7D7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn23Q9D7D7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn23Q9D7D7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn23Q9D7D7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn23Q9D7D7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn23Q9D7D7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn23Q9D7D7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn23Q9D7D7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn23Q9D7D7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn23Q9D7D7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn23Q9D7D7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn23Q9D7D7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn23Q9D7D7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn23Q9D7D7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn23Q9D7D7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn23Q9D7D7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn23Q9D7D7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn23Q9D7D7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn23Q9D7D7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn23Q9D7D7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn23Q9D7D7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn23Q9D7D7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn23Q9D7D7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn23Q9D7D7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn23Q9D7D7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn23Q9D7D7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn23Q9D7D7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn23Q9D7D7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn23Q9D7D7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn23Q9D7D7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn23Q9D7D7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn23Q9D7D7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn23Q9D7D7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn23Q9D7D7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn23Q9D7D7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn23Q9D7D7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn23Q9D7D7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn23Q9D7D7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn23Q9D7D7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn23Q9D7D7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn23Q9D7D7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn23Q9D7D7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cldn23Q9D7D7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn23Q9D7D7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn23Q9D7D7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn23Q9D7D7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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