Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MsraQ9D6Y7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MsraQ9D6Y7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MsraQ9D6Y7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MsraQ9D6Y7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MsraQ9D6Y7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MsraQ9D6Y7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MsraQ9D6Y7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MsraQ9D6Y7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MsraQ9D6Y7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MsraQ9D6Y7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MsraQ9D6Y7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MsraQ9D6Y7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MsraQ9D6Y7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MsraQ9D6Y7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MsraQ9D6Y7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MsraQ9D6Y7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MsraQ9D6Y7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MsraQ9D6Y7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MsraQ9D6Y7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MsraQ9D6Y7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MsraQ9D6Y7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MsraQ9D6Y7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MsraQ9D6Y7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MsraQ9D6Y7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MsraQ9D6Y7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MsraQ9D6Y7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MsraQ9D6Y7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MsraQ9D6Y7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MsraQ9D6Y7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MsraQ9D6Y7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
MsraQ9D6Y7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MsraQ9D6Y7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MsraQ9D6Y7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MsraQ9D6Y7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MsraQ9D6Y7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MsraQ9D6Y7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MsraQ9D6Y7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MsraQ9D6Y7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MsraQ9D6Y7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MsraQ9D6Y7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MsraQ9D6Y7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MsraQ9D6Y7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MsraQ9D6Y7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MsraQ9D6Y7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MsraQ9D6Y7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MsraQ9D6Y7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MsraQ9D6Y7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MsraQ9D6Y7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MsraQ9D6Y7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MsraQ9D6Y7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MsraQ9D6Y7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MsraQ9D6Y7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MsraQ9D6Y7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MsraQ9D6Y7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MsraQ9D6Y7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MsraQ9D6Y7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MsraQ9D6Y7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MsraQ9D6Y7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MsraQ9D6Y7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MsraQ9D6Y7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MsraQ9D6Y7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MsraQ9D6Y7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MsraQ9D6Y7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MsraQ9D6Y7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MsraQ9D6Y7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MsraQ9D6Y7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MsraQ9D6Y7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MsraQ9D6Y7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MsraQ9D6Y7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MsraQ9D6Y7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MsraQ9D6Y7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MsraQ9D6Y7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MsraQ9D6Y7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MsraQ9D6Y7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MsraQ9D6Y7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MsraQ9D6Y7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MsraQ9D6Y7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MsraQ9D6Y7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MsraQ9D6Y7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MsraQ9D6Y7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MsraQ9D6Y7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MsraQ9D6Y7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MsraQ9D6Y7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MsraQ9D6Y7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MsraQ9D6Y7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MsraQ9D6Y7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
MsraQ9D6Y7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MsraQ9D6Y7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MsraQ9D6Y7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MsraQ9D6Y7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MsraQ9D6Y7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MsraQ9D6Y7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MsraQ9D6Y7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MsraQ9D6Y7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MsraQ9D6Y7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MsraQ9D6Y7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MsraQ9D6Y7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MsraQ9D6Y7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MsraQ9D6Y7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms