Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tube1Q9D6T1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tube1Q9D6T1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tube1Q9D6T1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tube1Q9D6T1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tube1Q9D6T1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tube1Q9D6T1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tube1Q9D6T1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tube1Q9D6T1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tube1Q9D6T1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tube1Q9D6T1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tube1Q9D6T1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tube1Q9D6T1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tube1Q9D6T1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tube1Q9D6T1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tube1Q9D6T1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tube1Q9D6T1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tube1Q9D6T1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Tube1Q9D6T1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tube1Q9D6T1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tube1Q9D6T1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tube1Q9D6T1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tube1Q9D6T1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tube1Q9D6T1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Tube1Q9D6T1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tube1Q9D6T1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tube1Q9D6T1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tube1Q9D6T1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tube1Q9D6T1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tube1Q9D6T1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tube1Q9D6T1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tube1Q9D6T1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tube1Q9D6T1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tube1Q9D6T1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tube1Q9D6T1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tube1Q9D6T1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tube1Q9D6T1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Tube1Q9D6T1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tube1Q9D6T1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tube1Q9D6T1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tube1Q9D6T1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tube1Q9D6T1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tube1Q9D6T1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tube1Q9D6T1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tube1Q9D6T1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tube1Q9D6T1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tube1Q9D6T1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tube1Q9D6T1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tube1Q9D6T1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tube1Q9D6T1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tube1Q9D6T1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tube1Q9D6T1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tube1Q9D6T1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tube1Q9D6T1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tube1Q9D6T1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tube1Q9D6T1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tube1Q9D6T1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tube1Q9D6T1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tube1Q9D6T1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tube1Q9D6T1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tube1Q9D6T1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tube1Q9D6T1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tube1Q9D6T1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tube1Q9D6T1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tube1Q9D6T1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tube1Q9D6T1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tube1Q9D6T1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tube1Q9D6T1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tube1Q9D6T1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Tube1Q9D6T1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tube1Q9D6T1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tube1Q9D6T1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Tube1Q9D6T1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tube1Q9D6T1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tube1Q9D6T1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tube1Q9D6T1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tube1Q9D6T1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tube1Q9D6T1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tube1Q9D6T1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tube1Q9D6T1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tube1Q9D6T1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tube1Q9D6T1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tube1Q9D6T1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tube1Q9D6T1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tube1Q9D6T1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tube1Q9D6T1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Tube1Q9D6T1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tube1Q9D6T1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tube1Q9D6T1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tube1Q9D6T1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tube1Q9D6T1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tube1Q9D6T1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tube1Q9D6T1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tube1Q9D6T1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tube1Q9D6T1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tube1Q9D6T1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tube1Q9D6T1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tube1Q9D6T1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tube1Q9D6T1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tube1Q9D6T1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms