Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab11fip1Q9D620 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab11fip1Q9D620 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab11fip1Q9D620 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab11fip1Q9D620 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab11fip1Q9D620 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab11fip1Q9D620 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab11fip1Q9D620 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab11fip1Q9D620 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab11fip1Q9D620 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab11fip1Q9D620 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab11fip1Q9D620 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab11fip1Q9D620 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rab11fip1Q9D620 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab11fip1Q9D620 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab11fip1Q9D620 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab11fip1Q9D620 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab11fip1Q9D620 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab11fip1Q9D620 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab11fip1Q9D620 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab11fip1Q9D620 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab11fip1Q9D620 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab11fip1Q9D620 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab11fip1Q9D620 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab11fip1Q9D620 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab11fip1Q9D620 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab11fip1Q9D620 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab11fip1Q9D620 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab11fip1Q9D620 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab11fip1Q9D620 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab11fip1Q9D620 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab11fip1Q9D620 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab11fip1Q9D620 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab11fip1Q9D620 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab11fip1Q9D620 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab11fip1Q9D620 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab11fip1Q9D620 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab11fip1Q9D620 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab11fip1Q9D620 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab11fip1Q9D620 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab11fip1Q9D620 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab11fip1Q9D620 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab11fip1Q9D620 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab11fip1Q9D620 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab11fip1Q9D620 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab11fip1Q9D620 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Rab11fip1Q9D620 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab11fip1Q9D620 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab11fip1Q9D620 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab11fip1Q9D620 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab11fip1Q9D620 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab11fip1Q9D620 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab11fip1Q9D620 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab11fip1Q9D620 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab11fip1Q9D620 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab11fip1Q9D620 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab11fip1Q9D620 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab11fip1Q9D620 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab11fip1Q9D620 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab11fip1Q9D620 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab11fip1Q9D620 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab11fip1Q9D620 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab11fip1Q9D620 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab11fip1Q9D620 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab11fip1Q9D620 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab11fip1Q9D620 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab11fip1Q9D620 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab11fip1Q9D620 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab11fip1Q9D620 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab11fip1Q9D620 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab11fip1Q9D620 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab11fip1Q9D620 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab11fip1Q9D620 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab11fip1Q9D620 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab11fip1Q9D620 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab11fip1Q9D620 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab11fip1Q9D620 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab11fip1Q9D620 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab11fip1Q9D620 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab11fip1Q9D620 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab11fip1Q9D620 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rab11fip1Q9D620 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rab11fip1Q9D620 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rab11fip1Q9D620 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab11fip1Q9D620 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab11fip1Q9D620 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab11fip1Q9D620 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab11fip1Q9D620 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab11fip1Q9D620 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab11fip1Q9D620 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab11fip1Q9D620 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab11fip1Q9D620 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab11fip1Q9D620 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rab11fip1Q9D620 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab11fip1Q9D620 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab11fip1Q9D620 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab11fip1Q9D620 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab11fip1Q9D620 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rab11fip1Q9D620 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rab11fip1Q9D620 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
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