Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930449I24RikQ9D5E3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930449I24RikQ9D5E3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930449I24RikQ9D5E3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930449I24RikQ9D5E3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930449I24RikQ9D5E3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930449I24RikQ9D5E3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930449I24RikQ9D5E3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930449I24RikQ9D5E3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930449I24RikQ9D5E3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930449I24RikQ9D5E3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930449I24RikQ9D5E3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930449I24RikQ9D5E3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930449I24RikQ9D5E3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930449I24RikQ9D5E3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930449I24RikQ9D5E3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930449I24RikQ9D5E3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930449I24RikQ9D5E3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930449I24RikQ9D5E3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930449I24RikQ9D5E3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930449I24RikQ9D5E3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930449I24RikQ9D5E3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930449I24RikQ9D5E3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930449I24RikQ9D5E3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930449I24RikQ9D5E3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930449I24RikQ9D5E3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930449I24RikQ9D5E3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930449I24RikQ9D5E3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930449I24RikQ9D5E3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930449I24RikQ9D5E3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930449I24RikQ9D5E3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930449I24RikQ9D5E3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930449I24RikQ9D5E3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930449I24RikQ9D5E3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930449I24RikQ9D5E3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
4930449I24RikQ9D5E3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
4930449I24RikQ9D5E3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
4930449I24RikQ9D5E3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930449I24RikQ9D5E3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930449I24RikQ9D5E3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930449I24RikQ9D5E3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930449I24RikQ9D5E3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930449I24RikQ9D5E3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930449I24RikQ9D5E3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930449I24RikQ9D5E3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930449I24RikQ9D5E3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930449I24RikQ9D5E3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930449I24RikQ9D5E3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930449I24RikQ9D5E3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930449I24RikQ9D5E3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930449I24RikQ9D5E3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930449I24RikQ9D5E3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930449I24RikQ9D5E3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930449I24RikQ9D5E3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930449I24RikQ9D5E3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930449I24RikQ9D5E3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930449I24RikQ9D5E3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930449I24RikQ9D5E3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930449I24RikQ9D5E3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930449I24RikQ9D5E3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930449I24RikQ9D5E3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930449I24RikQ9D5E3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930449I24RikQ9D5E3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930449I24RikQ9D5E3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930449I24RikQ9D5E3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930449I24RikQ9D5E3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930449I24RikQ9D5E3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930449I24RikQ9D5E3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930449I24RikQ9D5E3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930449I24RikQ9D5E3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930449I24RikQ9D5E3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930449I24RikQ9D5E3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930449I24RikQ9D5E3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930449I24RikQ9D5E3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930449I24RikQ9D5E3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930449I24RikQ9D5E3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930449I24RikQ9D5E3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930449I24RikQ9D5E3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930449I24RikQ9D5E3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930449I24RikQ9D5E3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930449I24RikQ9D5E3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930449I24RikQ9D5E3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930449I24RikQ9D5E3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930449I24RikQ9D5E3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930449I24RikQ9D5E3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930449I24RikQ9D5E3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930449I24RikQ9D5E3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930449I24RikQ9D5E3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930449I24RikQ9D5E3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930449I24RikQ9D5E3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930449I24RikQ9D5E3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930449I24RikQ9D5E3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930449I24RikQ9D5E3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930449I24RikQ9D5E3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930449I24RikQ9D5E3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930449I24RikQ9D5E3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930449I24RikQ9D5E3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930449I24RikQ9D5E3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms