Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Odf2lQ9D478 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Odf2lQ9D478 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Odf2lQ9D478 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Odf2lQ9D478 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27,83■■■□□ 2,05
Odf2lQ9D478 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Odf2lQ9D478 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Odf2lQ9D478 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Odf2lQ9D478 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Odf2lQ9D478 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Odf2lQ9D478 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Odf2lQ9D478 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Odf2lQ9D478 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Odf2lQ9D478 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Odf2lQ9D478 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Odf2lQ9D478 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Odf2lQ9D478 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Odf2lQ9D478 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Odf2lQ9D478 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,04
Odf2lQ9D478 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Odf2lQ9D478 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Odf2lQ9D478 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Odf2lQ9D478 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Odf2lQ9D478 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Odf2lQ9D478 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Odf2lQ9D478 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Odf2lQ9D478 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Odf2lQ9D478 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Odf2lQ9D478 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Odf2lQ9D478 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Odf2lQ9D478 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Odf2lQ9D478 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Odf2lQ9D478 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Odf2lQ9D478 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Odf2lQ9D478 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,7■■■□□ 2,02
Odf2lQ9D478 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Odf2lQ9D478 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Odf2lQ9D478 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Odf2lQ9D478 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Odf2lQ9D478 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Odf2lQ9D478 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Odf2lQ9D478 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Odf2lQ9D478 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Odf2lQ9D478 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Odf2lQ9D478 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Odf2lQ9D478 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Odf2lQ9D478 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Odf2lQ9D478 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Odf2lQ9D478 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Odf2lQ9D478 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Odf2lQ9D478 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Odf2lQ9D478 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Odf2lQ9D478 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Odf2lQ9D478 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Odf2lQ9D478 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Odf2lQ9D478 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Odf2lQ9D478 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Odf2lQ9D478 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Odf2lQ9D478 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Odf2lQ9D478 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Odf2lQ9D478 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Odf2lQ9D478 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Odf2lQ9D478 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Odf2lQ9D478 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Odf2lQ9D478 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27,57■■■□□ 2
Odf2lQ9D478 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27,57■■■□□ 2
Odf2lQ9D478 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Odf2lQ9D478 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27,57■■■□□ 2
Odf2lQ9D478 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Odf2lQ9D478 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Odf2lQ9D478 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Odf2lQ9D478 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27,56■■■□□ 2
Odf2lQ9D478 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Odf2lQ9D478 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Odf2lQ9D478 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Odf2lQ9D478 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Odf2lQ9D478 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Odf2lQ9D478 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Odf2lQ9D478 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
Odf2lQ9D478 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
Odf2lQ9D478 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27,52■■■□□ 2
Odf2lQ9D478 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
Odf2lQ9D478 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Odf2lQ9D478 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
Odf2lQ9D478 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■■□□ 2
Odf2lQ9D478 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■■□□ 2
Odf2lQ9D478 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Odf2lQ9D478 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Odf2lQ9D478 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Odf2lQ9D478 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Odf2lQ9D478 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Odf2lQ9D478 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Odf2lQ9D478 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Odf2lQ9D478 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Odf2lQ9D478 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Odf2lQ9D478 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Odf2lQ9D478 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Odf2lQ9D478 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Odf2lQ9D478 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27,47■■□□□ 1,99
Odf2lQ9D478 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58,1 ms