Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4933436I01RikQ9D3T1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933436I01RikQ9D3T1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933436I01RikQ9D3T1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933436I01RikQ9D3T1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933436I01RikQ9D3T1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933436I01RikQ9D3T1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933436I01RikQ9D3T1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933436I01RikQ9D3T1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933436I01RikQ9D3T1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933436I01RikQ9D3T1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933436I01RikQ9D3T1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933436I01RikQ9D3T1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933436I01RikQ9D3T1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933436I01RikQ9D3T1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933436I01RikQ9D3T1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933436I01RikQ9D3T1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933436I01RikQ9D3T1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933436I01RikQ9D3T1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
4933436I01RikQ9D3T1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933436I01RikQ9D3T1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933436I01RikQ9D3T1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933436I01RikQ9D3T1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933436I01RikQ9D3T1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933436I01RikQ9D3T1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933436I01RikQ9D3T1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933436I01RikQ9D3T1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933436I01RikQ9D3T1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933436I01RikQ9D3T1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933436I01RikQ9D3T1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933436I01RikQ9D3T1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933436I01RikQ9D3T1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933436I01RikQ9D3T1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933436I01RikQ9D3T1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933436I01RikQ9D3T1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933436I01RikQ9D3T1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933436I01RikQ9D3T1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
4933436I01RikQ9D3T1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933436I01RikQ9D3T1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933436I01RikQ9D3T1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933436I01RikQ9D3T1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933436I01RikQ9D3T1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933436I01RikQ9D3T1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933436I01RikQ9D3T1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933436I01RikQ9D3T1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933436I01RikQ9D3T1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
4933436I01RikQ9D3T1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
4933436I01RikQ9D3T1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933436I01RikQ9D3T1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
4933436I01RikQ9D3T1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933436I01RikQ9D3T1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933436I01RikQ9D3T1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933436I01RikQ9D3T1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933436I01RikQ9D3T1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933436I01RikQ9D3T1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933436I01RikQ9D3T1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933436I01RikQ9D3T1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933436I01RikQ9D3T1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933436I01RikQ9D3T1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
4933436I01RikQ9D3T1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933436I01RikQ9D3T1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933436I01RikQ9D3T1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933436I01RikQ9D3T1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933436I01RikQ9D3T1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933436I01RikQ9D3T1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933436I01RikQ9D3T1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933436I01RikQ9D3T1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933436I01RikQ9D3T1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933436I01RikQ9D3T1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933436I01RikQ9D3T1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933436I01RikQ9D3T1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933436I01RikQ9D3T1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933436I01RikQ9D3T1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933436I01RikQ9D3T1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933436I01RikQ9D3T1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
4933436I01RikQ9D3T1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933436I01RikQ9D3T1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933436I01RikQ9D3T1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933436I01RikQ9D3T1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933436I01RikQ9D3T1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4933436I01RikQ9D3T1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
4933436I01RikQ9D3T1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4933436I01RikQ9D3T1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933436I01RikQ9D3T1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933436I01RikQ9D3T1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933436I01RikQ9D3T1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933436I01RikQ9D3T1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933436I01RikQ9D3T1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933436I01RikQ9D3T1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933436I01RikQ9D3T1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933436I01RikQ9D3T1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933436I01RikQ9D3T1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4933436I01RikQ9D3T1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933436I01RikQ9D3T1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933436I01RikQ9D3T1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933436I01RikQ9D3T1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933436I01RikQ9D3T1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933436I01RikQ9D3T1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933436I01RikQ9D3T1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms