Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Creb3l4Q9D2A5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Creb3l4Q9D2A5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Creb3l4Q9D2A5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Creb3l4Q9D2A5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Creb3l4Q9D2A5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Creb3l4Q9D2A5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Creb3l4Q9D2A5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Creb3l4Q9D2A5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Creb3l4Q9D2A5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Creb3l4Q9D2A5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Creb3l4Q9D2A5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Creb3l4Q9D2A5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Creb3l4Q9D2A5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Creb3l4Q9D2A5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Creb3l4Q9D2A5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Creb3l4Q9D2A5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Creb3l4Q9D2A5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Creb3l4Q9D2A5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Creb3l4Q9D2A5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Creb3l4Q9D2A5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Creb3l4Q9D2A5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Creb3l4Q9D2A5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Creb3l4Q9D2A5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Creb3l4Q9D2A5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Creb3l4Q9D2A5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Creb3l4Q9D2A5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Creb3l4Q9D2A5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Creb3l4Q9D2A5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Creb3l4Q9D2A5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Creb3l4Q9D2A5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Creb3l4Q9D2A5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Creb3l4Q9D2A5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Creb3l4Q9D2A5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Creb3l4Q9D2A5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Creb3l4Q9D2A5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Creb3l4Q9D2A5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Creb3l4Q9D2A5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Creb3l4Q9D2A5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Creb3l4Q9D2A5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Creb3l4Q9D2A5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Creb3l4Q9D2A5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Creb3l4Q9D2A5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Creb3l4Q9D2A5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Creb3l4Q9D2A5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Creb3l4Q9D2A5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Creb3l4Q9D2A5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Creb3l4Q9D2A5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Creb3l4Q9D2A5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Creb3l4Q9D2A5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Creb3l4Q9D2A5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Creb3l4Q9D2A5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Creb3l4Q9D2A5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Creb3l4Q9D2A5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Creb3l4Q9D2A5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Creb3l4Q9D2A5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Creb3l4Q9D2A5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Creb3l4Q9D2A5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Creb3l4Q9D2A5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Creb3l4Q9D2A5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Creb3l4Q9D2A5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Creb3l4Q9D2A5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Creb3l4Q9D2A5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Creb3l4Q9D2A5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Creb3l4Q9D2A5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Creb3l4Q9D2A5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Creb3l4Q9D2A5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Creb3l4Q9D2A5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Creb3l4Q9D2A5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Creb3l4Q9D2A5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Creb3l4Q9D2A5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Creb3l4Q9D2A5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Creb3l4Q9D2A5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Creb3l4Q9D2A5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Creb3l4Q9D2A5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Creb3l4Q9D2A5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Creb3l4Q9D2A5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Creb3l4Q9D2A5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Creb3l4Q9D2A5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Creb3l4Q9D2A5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Creb3l4Q9D2A5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Creb3l4Q9D2A5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Creb3l4Q9D2A5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Creb3l4Q9D2A5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Creb3l4Q9D2A5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Creb3l4Q9D2A5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Creb3l4Q9D2A5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Creb3l4Q9D2A5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Creb3l4Q9D2A5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Creb3l4Q9D2A5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Creb3l4Q9D2A5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Creb3l4Q9D2A5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Creb3l4Q9D2A5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Creb3l4Q9D2A5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Creb3l4Q9D2A5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Creb3l4Q9D2A5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Creb3l4Q9D2A5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Creb3l4Q9D2A5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Creb3l4Q9D2A5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Creb3l4Q9D2A5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.7 ms