Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NkapQ9D0F4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NkapQ9D0F4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NkapQ9D0F4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NkapQ9D0F4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NkapQ9D0F4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NkapQ9D0F4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NkapQ9D0F4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NkapQ9D0F4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NkapQ9D0F4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NkapQ9D0F4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NkapQ9D0F4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NkapQ9D0F4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NkapQ9D0F4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NkapQ9D0F4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NkapQ9D0F4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NkapQ9D0F4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NkapQ9D0F4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NkapQ9D0F4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NkapQ9D0F4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NkapQ9D0F4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NkapQ9D0F4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NkapQ9D0F4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NkapQ9D0F4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NkapQ9D0F4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NkapQ9D0F4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NkapQ9D0F4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NkapQ9D0F4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NkapQ9D0F4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NkapQ9D0F4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NkapQ9D0F4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NkapQ9D0F4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NkapQ9D0F4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NkapQ9D0F4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NkapQ9D0F4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NkapQ9D0F4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NkapQ9D0F4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NkapQ9D0F4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NkapQ9D0F4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NkapQ9D0F4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NkapQ9D0F4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NkapQ9D0F4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NkapQ9D0F4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NkapQ9D0F4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NkapQ9D0F4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NkapQ9D0F4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NkapQ9D0F4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NkapQ9D0F4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NkapQ9D0F4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NkapQ9D0F4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NkapQ9D0F4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NkapQ9D0F4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NkapQ9D0F4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NkapQ9D0F4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NkapQ9D0F4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NkapQ9D0F4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NkapQ9D0F4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NkapQ9D0F4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NkapQ9D0F4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NkapQ9D0F4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NkapQ9D0F4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NkapQ9D0F4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NkapQ9D0F4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NkapQ9D0F4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NkapQ9D0F4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NkapQ9D0F4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NkapQ9D0F4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NkapQ9D0F4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NkapQ9D0F4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NkapQ9D0F4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NkapQ9D0F4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NkapQ9D0F4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NkapQ9D0F4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NkapQ9D0F4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NkapQ9D0F4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NkapQ9D0F4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NkapQ9D0F4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NkapQ9D0F4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NkapQ9D0F4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NkapQ9D0F4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NkapQ9D0F4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NkapQ9D0F4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NkapQ9D0F4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NkapQ9D0F4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NkapQ9D0F4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NkapQ9D0F4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NkapQ9D0F4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NkapQ9D0F4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NkapQ9D0F4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NkapQ9D0F4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NkapQ9D0F4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NkapQ9D0F4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NkapQ9D0F4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NkapQ9D0F4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NkapQ9D0F4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NkapQ9D0F4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NkapQ9D0F4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NkapQ9D0F4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NkapQ9D0F4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NkapQ9D0F4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms