Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ6

Rex1bd, Required for excision 1-B domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rex1bdQ9CYZ6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rex1bdQ9CYZ6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms