Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sgo1Q9CXH7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sgo1Q9CXH7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sgo1Q9CXH7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sgo1Q9CXH7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sgo1Q9CXH7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sgo1Q9CXH7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sgo1Q9CXH7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgo1Q9CXH7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgo1Q9CXH7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgo1Q9CXH7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgo1Q9CXH7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgo1Q9CXH7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgo1Q9CXH7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sgo1Q9CXH7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sgo1Q9CXH7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sgo1Q9CXH7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sgo1Q9CXH7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sgo1Q9CXH7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sgo1Q9CXH7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sgo1Q9CXH7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sgo1Q9CXH7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sgo1Q9CXH7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sgo1Q9CXH7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sgo1Q9CXH7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sgo1Q9CXH7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sgo1Q9CXH7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sgo1Q9CXH7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sgo1Q9CXH7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sgo1Q9CXH7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sgo1Q9CXH7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sgo1Q9CXH7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sgo1Q9CXH7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sgo1Q9CXH7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sgo1Q9CXH7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sgo1Q9CXH7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sgo1Q9CXH7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sgo1Q9CXH7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sgo1Q9CXH7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sgo1Q9CXH7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sgo1Q9CXH7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sgo1Q9CXH7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sgo1Q9CXH7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sgo1Q9CXH7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sgo1Q9CXH7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sgo1Q9CXH7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sgo1Q9CXH7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sgo1Q9CXH7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sgo1Q9CXH7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sgo1Q9CXH7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sgo1Q9CXH7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sgo1Q9CXH7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sgo1Q9CXH7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sgo1Q9CXH7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sgo1Q9CXH7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sgo1Q9CXH7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sgo1Q9CXH7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sgo1Q9CXH7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sgo1Q9CXH7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sgo1Q9CXH7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sgo1Q9CXH7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgo1Q9CXH7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgo1Q9CXH7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgo1Q9CXH7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgo1Q9CXH7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sgo1Q9CXH7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sgo1Q9CXH7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sgo1Q9CXH7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sgo1Q9CXH7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgo1Q9CXH7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgo1Q9CXH7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgo1Q9CXH7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgo1Q9CXH7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgo1Q9CXH7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgo1Q9CXH7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgo1Q9CXH7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgo1Q9CXH7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgo1Q9CXH7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgo1Q9CXH7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgo1Q9CXH7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgo1Q9CXH7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgo1Q9CXH7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgo1Q9CXH7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgo1Q9CXH7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgo1Q9CXH7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgo1Q9CXH7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgo1Q9CXH7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgo1Q9CXH7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgo1Q9CXH7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgo1Q9CXH7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgo1Q9CXH7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgo1Q9CXH7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgo1Q9CXH7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgo1Q9CXH7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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