Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY3

Setd6, N-lysine methyltransferase SETD6, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd6Q9CWY3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd6Q9CWY3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd6Q9CWY3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd6Q9CWY3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd6Q9CWY3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd6Q9CWY3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd6Q9CWY3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd6Q9CWY3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd6Q9CWY3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd6Q9CWY3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd6Q9CWY3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd6Q9CWY3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd6Q9CWY3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Setd6Q9CWY3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Setd6Q9CWY3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms