Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Khdc3Q9CWU5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Khdc3Q9CWU5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Khdc3Q9CWU5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Khdc3Q9CWU5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Khdc3Q9CWU5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Khdc3Q9CWU5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Khdc3Q9CWU5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Khdc3Q9CWU5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Khdc3Q9CWU5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Khdc3Q9CWU5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Khdc3Q9CWU5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Khdc3Q9CWU5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Khdc3Q9CWU5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Khdc3Q9CWU5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Khdc3Q9CWU5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Khdc3Q9CWU5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Khdc3Q9CWU5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Khdc3Q9CWU5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Khdc3Q9CWU5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Khdc3Q9CWU5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Khdc3Q9CWU5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Khdc3Q9CWU5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Khdc3Q9CWU5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Khdc3Q9CWU5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Khdc3Q9CWU5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Khdc3Q9CWU5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Khdc3Q9CWU5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Khdc3Q9CWU5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Khdc3Q9CWU5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Khdc3Q9CWU5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Khdc3Q9CWU5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Khdc3Q9CWU5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Khdc3Q9CWU5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Khdc3Q9CWU5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Khdc3Q9CWU5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Khdc3Q9CWU5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Khdc3Q9CWU5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Khdc3Q9CWU5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Khdc3Q9CWU5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Khdc3Q9CWU5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Khdc3Q9CWU5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Khdc3Q9CWU5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Khdc3Q9CWU5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Khdc3Q9CWU5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Khdc3Q9CWU5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Khdc3Q9CWU5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Khdc3Q9CWU5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Khdc3Q9CWU5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Khdc3Q9CWU5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Khdc3Q9CWU5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Khdc3Q9CWU5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Khdc3Q9CWU5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Khdc3Q9CWU5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Khdc3Q9CWU5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Khdc3Q9CWU5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Khdc3Q9CWU5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Khdc3Q9CWU5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Khdc3Q9CWU5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Khdc3Q9CWU5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Khdc3Q9CWU5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Khdc3Q9CWU5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Khdc3Q9CWU5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Khdc3Q9CWU5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Khdc3Q9CWU5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Khdc3Q9CWU5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Khdc3Q9CWU5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Khdc3Q9CWU5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Khdc3Q9CWU5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Khdc3Q9CWU5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Khdc3Q9CWU5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Khdc3Q9CWU5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Khdc3Q9CWU5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Khdc3Q9CWU5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Khdc3Q9CWU5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Khdc3Q9CWU5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Khdc3Q9CWU5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Khdc3Q9CWU5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Khdc3Q9CWU5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Khdc3Q9CWU5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Khdc3Q9CWU5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Khdc3Q9CWU5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Khdc3Q9CWU5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Khdc3Q9CWU5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Khdc3Q9CWU5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Khdc3Q9CWU5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Khdc3Q9CWU5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Khdc3Q9CWU5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Khdc3Q9CWU5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Khdc3Q9CWU5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Khdc3Q9CWU5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Khdc3Q9CWU5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Khdc3Q9CWU5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Khdc3Q9CWU5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Khdc3Q9CWU5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Khdc3Q9CWU5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Khdc3Q9CWU5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Khdc3Q9CWU5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Khdc3Q9CWU5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Khdc3Q9CWU5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms