Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smyd3Q9CWR2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smyd3Q9CWR2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smyd3Q9CWR2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smyd3Q9CWR2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smyd3Q9CWR2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smyd3Q9CWR2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smyd3Q9CWR2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smyd3Q9CWR2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smyd3Q9CWR2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smyd3Q9CWR2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smyd3Q9CWR2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smyd3Q9CWR2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smyd3Q9CWR2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smyd3Q9CWR2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smyd3Q9CWR2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smyd3Q9CWR2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smyd3Q9CWR2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smyd3Q9CWR2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smyd3Q9CWR2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smyd3Q9CWR2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smyd3Q9CWR2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smyd3Q9CWR2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smyd3Q9CWR2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smyd3Q9CWR2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smyd3Q9CWR2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smyd3Q9CWR2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smyd3Q9CWR2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smyd3Q9CWR2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smyd3Q9CWR2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smyd3Q9CWR2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smyd3Q9CWR2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smyd3Q9CWR2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smyd3Q9CWR2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smyd3Q9CWR2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smyd3Q9CWR2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smyd3Q9CWR2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smyd3Q9CWR2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smyd3Q9CWR2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smyd3Q9CWR2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smyd3Q9CWR2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smyd3Q9CWR2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smyd3Q9CWR2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Smyd3Q9CWR2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Smyd3Q9CWR2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smyd3Q9CWR2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smyd3Q9CWR2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smyd3Q9CWR2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smyd3Q9CWR2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smyd3Q9CWR2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smyd3Q9CWR2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Smyd3Q9CWR2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smyd3Q9CWR2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Smyd3Q9CWR2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smyd3Q9CWR2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smyd3Q9CWR2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smyd3Q9CWR2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smyd3Q9CWR2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smyd3Q9CWR2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smyd3Q9CWR2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smyd3Q9CWR2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smyd3Q9CWR2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smyd3Q9CWR2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smyd3Q9CWR2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smyd3Q9CWR2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Smyd3Q9CWR2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smyd3Q9CWR2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smyd3Q9CWR2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smyd3Q9CWR2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smyd3Q9CWR2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smyd3Q9CWR2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smyd3Q9CWR2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smyd3Q9CWR2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smyd3Q9CWR2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smyd3Q9CWR2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smyd3Q9CWR2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smyd3Q9CWR2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smyd3Q9CWR2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Smyd3Q9CWR2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smyd3Q9CWR2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smyd3Q9CWR2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smyd3Q9CWR2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Smyd3Q9CWR2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smyd3Q9CWR2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smyd3Q9CWR2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smyd3Q9CWR2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smyd3Q9CWR2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smyd3Q9CWR2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Smyd3Q9CWR2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smyd3Q9CWR2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Smyd3Q9CWR2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Smyd3Q9CWR2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smyd3Q9CWR2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smyd3Q9CWR2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smyd3Q9CWR2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smyd3Q9CWR2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smyd3Q9CWR2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smyd3Q9CWR2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smyd3Q9CWR2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smyd3Q9CWR2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.4 ms