Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWG9

Bloc1s2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bloc1s2Q9CWG9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bloc1s2Q9CWG9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bloc1s2Q9CWG9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bloc1s2Q9CWG9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bloc1s2Q9CWG9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bloc1s2Q9CWG9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Bloc1s2Q9CWG9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Bloc1s2Q9CWG9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Bloc1s2Q9CWG9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Bloc1s2Q9CWG9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bloc1s2Q9CWG9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Bloc1s2Q9CWG9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Bloc1s2Q9CWG9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bloc1s2Q9CWG9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bloc1s2Q9CWG9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bloc1s2Q9CWG9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bloc1s2Q9CWG9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Bloc1s2Q9CWG9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bloc1s2Q9CWG9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bloc1s2Q9CWG9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bloc1s2Q9CWG9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bloc1s2Q9CWG9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bloc1s2Q9CWG9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bloc1s2Q9CWG9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bloc1s2Q9CWG9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Bloc1s2Q9CWG9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Bloc1s2Q9CWG9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Bloc1s2Q9CWG9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Bloc1s2Q9CWG9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Bloc1s2Q9CWG9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Bloc1s2Q9CWG9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Bloc1s2Q9CWG9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Bloc1s2Q9CWG9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Bloc1s2Q9CWG9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Bloc1s2Q9CWG9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Bloc1s2Q9CWG9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Bloc1s2Q9CWG9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bloc1s2Q9CWG9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bloc1s2Q9CWG9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bloc1s2Q9CWG9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bloc1s2Q9CWG9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bloc1s2Q9CWG9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bloc1s2Q9CWG9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bloc1s2Q9CWG9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Bloc1s2Q9CWG9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Bloc1s2Q9CWG9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Bloc1s2Q9CWG9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Bloc1s2Q9CWG9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Bloc1s2Q9CWG9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Bloc1s2Q9CWG9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Bloc1s2Q9CWG9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Bloc1s2Q9CWG9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Bloc1s2Q9CWG9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Bloc1s2Q9CWG9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Bloc1s2Q9CWG9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Bloc1s2Q9CWG9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bloc1s2Q9CWG9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bloc1s2Q9CWG9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bloc1s2Q9CWG9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bloc1s2Q9CWG9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bloc1s2Q9CWG9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bloc1s2Q9CWG9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Bloc1s2Q9CWG9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Bloc1s2Q9CWG9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Bloc1s2Q9CWG9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Bloc1s2Q9CWG9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Bloc1s2Q9CWG9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Bloc1s2Q9CWG9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Bloc1s2Q9CWG9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Bloc1s2Q9CWG9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Bloc1s2Q9CWG9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Bloc1s2Q9CWG9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Bloc1s2Q9CWG9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Bloc1s2Q9CWG9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Bloc1s2Q9CWG9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bloc1s2Q9CWG9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bloc1s2Q9CWG9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bloc1s2Q9CWG9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bloc1s2Q9CWG9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bloc1s2Q9CWG9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bloc1s2Q9CWG9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Bloc1s2Q9CWG9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Bloc1s2Q9CWG9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Bloc1s2Q9CWG9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Bloc1s2Q9CWG9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Bloc1s2Q9CWG9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Bloc1s2Q9CWG9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Bloc1s2Q9CWG9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Bloc1s2Q9CWG9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Bloc1s2Q9CWG9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Bloc1s2Q9CWG9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Bloc1s2Q9CWG9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Bloc1s2Q9CWG9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Bloc1s2Q9CWG9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Bloc1s2Q9CWG9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Bloc1s2Q9CWG9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Bloc1s2Q9CWG9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Bloc1s2Q9CWG9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Bloc1s2Q9CWG9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Bloc1s2Q9CWG9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms