Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smc3Q9CW03 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smc3Q9CW03 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smc3Q9CW03 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smc3Q9CW03 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smc3Q9CW03 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smc3Q9CW03 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smc3Q9CW03 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smc3Q9CW03 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smc3Q9CW03 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smc3Q9CW03 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smc3Q9CW03 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Smc3Q9CW03 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Smc3Q9CW03 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smc3Q9CW03 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
Smc3Q9CW03 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Smc3Q9CW03 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Smc3Q9CW03 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smc3Q9CW03 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smc3Q9CW03 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smc3Q9CW03 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smc3Q9CW03 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Smc3Q9CW03 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smc3Q9CW03 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smc3Q9CW03 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Smc3Q9CW03 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Smc3Q9CW03 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Smc3Q9CW03 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smc3Q9CW03 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smc3Q9CW03 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smc3Q9CW03 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smc3Q9CW03 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smc3Q9CW03 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smc3Q9CW03 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smc3Q9CW03 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smc3Q9CW03 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smc3Q9CW03 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smc3Q9CW03 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smc3Q9CW03 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smc3Q9CW03 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smc3Q9CW03 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smc3Q9CW03 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smc3Q9CW03 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smc3Q9CW03 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smc3Q9CW03 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smc3Q9CW03 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smc3Q9CW03 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smc3Q9CW03 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smc3Q9CW03 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smc3Q9CW03 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smc3Q9CW03 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smc3Q9CW03 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smc3Q9CW03 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smc3Q9CW03 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smc3Q9CW03 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smc3Q9CW03 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smc3Q9CW03 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smc3Q9CW03 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smc3Q9CW03 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smc3Q9CW03 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smc3Q9CW03 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smc3Q9CW03 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smc3Q9CW03 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smc3Q9CW03 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smc3Q9CW03 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smc3Q9CW03 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smc3Q9CW03 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smc3Q9CW03 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Smc3Q9CW03 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Smc3Q9CW03 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smc3Q9CW03 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smc3Q9CW03 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smc3Q9CW03 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smc3Q9CW03 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smc3Q9CW03 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smc3Q9CW03 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smc3Q9CW03 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smc3Q9CW03 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smc3Q9CW03 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smc3Q9CW03 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smc3Q9CW03 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smc3Q9CW03 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smc3Q9CW03 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smc3Q9CW03 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smc3Q9CW03 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smc3Q9CW03 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smc3Q9CW03 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smc3Q9CW03 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Smc3Q9CW03 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smc3Q9CW03 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smc3Q9CW03 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smc3Q9CW03 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smc3Q9CW03 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smc3Q9CW03 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smc3Q9CW03 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smc3Q9CW03 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smc3Q9CW03 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smc3Q9CW03 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smc3Q9CW03 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smc3Q9CW03 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118 ms