Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
Sycp2Q9CUU3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.87
Sycp2Q9CUU3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
Sycp2Q9CUU3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
Sycp2Q9CUU3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
Sycp2Q9CUU3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
Sycp2Q9CUU3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
Sycp2Q9CUU3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
Sycp2Q9CUU3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.39■■■■■ 4.86
Sycp2Q9CUU3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
Sycp2Q9CUU3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
Sycp2Q9CUU3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC45.37■■■■■ 4.85
Sycp2Q9CUU3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC45.36■■■■■ 4.85
Sycp2Q9CUU3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC45.36■■■■■ 4.85
Sycp2Q9CUU3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
Sycp2Q9CUU3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
Sycp2Q9CUU3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
Sycp2Q9CUU3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
Sycp2Q9CUU3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
Sycp2Q9CUU3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC45.32■■■■■ 4.85
Sycp2Q9CUU3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
Sycp2Q9CUU3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
Sycp2Q9CUU3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
Sycp2Q9CUU3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.29■■■■■ 4.84
Sycp2Q9CUU3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC45.29■■■■■ 4.84
Sycp2Q9CUU3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
Sycp2Q9CUU3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
Sycp2Q9CUU3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
Sycp2Q9CUU3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC45.28■■■■■ 4.84
Sycp2Q9CUU3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC45.28■■■■■ 4.84
Sycp2Q9CUU3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
Sycp2Q9CUU3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
Sycp2Q9CUU3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
Sycp2Q9CUU3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
Sycp2Q9CUU3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
Sycp2Q9CUU3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
Sycp2Q9CUU3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
Sycp2Q9CUU3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
Sycp2Q9CUU3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
Sycp2Q9CUU3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
Sycp2Q9CUU3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
Sycp2Q9CUU3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
Sycp2Q9CUU3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
Sycp2Q9CUU3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
Sycp2Q9CUU3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
Sycp2Q9CUU3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.81
Sycp2Q9CUU3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC45.11■■■■■ 4.81
Sycp2Q9CUU3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
Sycp2Q9CUU3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC45.11■■■■■ 4.81
Sycp2Q9CUU3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
Sycp2Q9CUU3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
Sycp2Q9CUU3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC45.09■■■■■ 4.81
Sycp2Q9CUU3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC45.09■■■■■ 4.81
Sycp2Q9CUU3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
Sycp2Q9CUU3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
Sycp2Q9CUU3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
Sycp2Q9CUU3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
Sycp2Q9CUU3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC45.06■■■■■ 4.8
Sycp2Q9CUU3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC45.06■■■■■ 4.8
Sycp2Q9CUU3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
Sycp2Q9CUU3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC45.05■■■■■ 4.8
Sycp2Q9CUU3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC45.04■■■■■ 4.8
Sycp2Q9CUU3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC45.04■■■■■ 4.8
Sycp2Q9CUU3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
Sycp2Q9CUU3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC45.03■■■■■ 4.8
Sycp2Q9CUU3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
Sycp2Q9CUU3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC45.01■■■■■ 4.8
Sycp2Q9CUU3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
Sycp2Q9CUU3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
Sycp2Q9CUU3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
Sycp2Q9CUU3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.98■■■■■ 4.79
Sycp2Q9CUU3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC44.95■■■■■ 4.79
Sycp2Q9CUU3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.95■■■■■ 4.79
Sycp2Q9CUU3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
Sycp2Q9CUU3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
Sycp2Q9CUU3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
Sycp2Q9CUU3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
Sycp2Q9CUU3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
Sycp2Q9CUU3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
Sycp2Q9CUU3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.9■■■■■ 4.78
Sycp2Q9CUU3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
Sycp2Q9CUU3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC44.87■■■■■ 4.77
Sycp2Q9CUU3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
Sycp2Q9CUU3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
Sycp2Q9CUU3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
Sycp2Q9CUU3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
Sycp2Q9CUU3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
Sycp2Q9CUU3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
Sycp2Q9CUU3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
Sycp2Q9CUU3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
Sycp2Q9CUU3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC44.83■■■■■ 4.77
Sycp2Q9CUU3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
Sycp2Q9CUU3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC44.8■■■■■ 4.76
Sycp2Q9CUU3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
Sycp2Q9CUU3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
Sycp2Q9CUU3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC44.79■■■■■ 4.76
Sycp2Q9CUU3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC44.79■■■■■ 4.76
Sycp2Q9CUU3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
Sycp2Q9CUU3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC44.77■■■■■ 4.76
Sycp2Q9CUU3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms