Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9CRC3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9CRC3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9CRC3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q9CRC3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q9CRC3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9CRC3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9CRC3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9CRC3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9CRC3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9CRC3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9CRC3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9CRC3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9CRC3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9CRC3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9CRC3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9CRC3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CRC3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CRC3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CRC3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CRC3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CRC3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CRC3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CRC3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9CRC3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9CRC3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CRC3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9CRC3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q9CRC3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9CRC3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9CRC3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9CRC3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CRC3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CRC3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CRC3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CRC3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CRC3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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