Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB9

Chchd3, MICOS complex subunit Mic19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd3Q9CRB9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chchd3Q9CRB9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chchd3Q9CRB9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chchd3Q9CRB9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chchd3Q9CRB9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chchd3Q9CRB9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chchd3Q9CRB9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chchd3Q9CRB9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chchd3Q9CRB9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chchd3Q9CRB9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chchd3Q9CRB9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Chchd3Q9CRB9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chchd3Q9CRB9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chchd3Q9CRB9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Chchd3Q9CRB9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chchd3Q9CRB9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chchd3Q9CRB9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chchd3Q9CRB9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chchd3Q9CRB9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chchd3Q9CRB9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Chchd3Q9CRB9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chchd3Q9CRB9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chchd3Q9CRB9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chchd3Q9CRB9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chchd3Q9CRB9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chchd3Q9CRB9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chchd3Q9CRB9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chchd3Q9CRB9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chchd3Q9CRB9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chchd3Q9CRB9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chchd3Q9CRB9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chchd3Q9CRB9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chchd3Q9CRB9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chchd3Q9CRB9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chchd3Q9CRB9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chchd3Q9CRB9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chchd3Q9CRB9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chchd3Q9CRB9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chchd3Q9CRB9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chchd3Q9CRB9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chchd3Q9CRB9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chchd3Q9CRB9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chchd3Q9CRB9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chchd3Q9CRB9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chchd3Q9CRB9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chchd3Q9CRB9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chchd3Q9CRB9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chchd3Q9CRB9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Chchd3Q9CRB9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chchd3Q9CRB9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chchd3Q9CRB9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chchd3Q9CRB9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chchd3Q9CRB9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chchd3Q9CRB9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chchd3Q9CRB9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chchd3Q9CRB9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chchd3Q9CRB9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chchd3Q9CRB9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chchd3Q9CRB9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chchd3Q9CRB9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chchd3Q9CRB9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Chchd3Q9CRB9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chchd3Q9CRB9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chchd3Q9CRB9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chchd3Q9CRB9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chchd3Q9CRB9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chchd3Q9CRB9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chchd3Q9CRB9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chchd3Q9CRB9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chchd3Q9CRB9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chchd3Q9CRB9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chchd3Q9CRB9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chchd3Q9CRB9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chchd3Q9CRB9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chchd3Q9CRB9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chchd3Q9CRB9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chchd3Q9CRB9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chchd3Q9CRB9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chchd3Q9CRB9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chchd3Q9CRB9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chchd3Q9CRB9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chchd3Q9CRB9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chchd3Q9CRB9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chchd3Q9CRB9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chchd3Q9CRB9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chchd3Q9CRB9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chchd3Q9CRB9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chchd3Q9CRB9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chchd3Q9CRB9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chchd3Q9CRB9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chchd3Q9CRB9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chchd3Q9CRB9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chchd3Q9CRB9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chchd3Q9CRB9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chchd3Q9CRB9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chchd3Q9CRB9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chchd3Q9CRB9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chchd3Q9CRB9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chchd3Q9CRB9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chchd3Q9CRB9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms